اگر همه مي توانستند از استعدادهاي خود درست بهره بگيرند، دنيا همان بهشت موعود مي شد که همه مي خواهند. زکرياي رازي
به چه کار آيدت ز گل طبقی ز گلستان من ببر ورقی
گل همين پنج روز و شش باشد وين گلستان هميشه خوش باشد ( سعدی)
- راز جواني من در اين است که هر روز چيز تازه اي ياد مي گيريم . سولون
اين سايت جهت استفاده دانشجويان، بخصوص رشته اصلاح نبات (اصلاح نباتات) طراحي شده است - اميد که مقبول افتد. در ابتدا جهت آشنايي با رشته اصلاح نباتات ميتوان به آدرس زير مراجعه نمود
مصاحبه با آقای دکتر مامقانی استاد دانشگاه شهید چمران اهواز در این رابطه:
به نقل از سایت انجمن علمی زراعت و اصلاح آن دانشگاه
... به رسم کسوت این بخش رو با گفتگویی با جناب آقای دکتر رضا مامقانی آغاز کردیم.
از همکاری صمیمانه جناب آقای دکترمامقانی در تهیه این مصاحبه نهایت تشکر را می نماییم.
ای مصاحبه در نشریه ی خوشه(نشریه ی اختصاصی انجمن علمی) هم به چاپ رسید.
با عرض سلام و خسته نباشید خدمت جناب آقای دکتر مامقانی:
ابتدادر مورد خودتان صحبت کنید و از زندگی و تجربیات تحصیلاتتان بگویید.
من دانشیار پایه 26 گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید چمران هستم که از فروردین 1356 در این گروه مشغول به کار بوده ام. در سال 1322 در خانواده ای روحانی در تبریز بدنیا آمدم و با عزیمت به تهران به همراه خانواده تمام تحصیلات خود را تا پایان دبیرستان در تهران گذراندم. در سال 1341 وارد دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران شدم و دوره چهارساله پیوسته ی فوق لیسانس را در سال 1345 در رشته ی عمومی کشاورزی به پایان رساندم. پس از دوره ی خدمت سربازی نزدیک به سه سال در اداره ی کل مهندسی زراعی وزارت کشاورزی به عنوان کارشناس راندمان های آبیاری مشغول به کار شدم. و در سال 1350 به کشور آمریکا عزیمت کردم و در دانشگاه اوکلاهاما مشغول به تحصیل شدم و مدارک MS و Ph.D خود را در اصلاح نباتات از آن دانشگاه اخذ و در اسفند1355 به وطن مراجعت نمودم و از همان زمان تا کنون در این دانشگاه مشغول به کار هستم.
در مورد رشته ی اصلاح نباتات و اهمیت آن در کشاورزی توضیح دهید.
اصولاً اصلاح نباتات که بر پایه ی علم ژنتیک و بعضی علوم دیگر بنا نهاده شده علم جدیدی است ولی با سرعت بسیار زیادی نسبت به سایر رشته ها پیش می رود مخصوصاً رشته ی بیوتکنولوژی گیاهی که هر روز شاهد پیشرفت های جدیدی در این رشته هستیم. باتوجه به محدودیت منابع آب و زمین و نیز افزایش جمعیت جهان، برای تأمین محصولات کشاوزری مورد نیاز باید از علوم جدید اصلاح نباتات، بیوتکنولوژی گیاهی وسایر رشته های کشاورزی بهره برداری کرد. که بدون اغراق یکی از مطمئن ترین و مفیدترین راهها، اصلاح نباتات می باشد.
گرایش های مربوط به اصلاح نباتات درمقطع کارشناسی ارشد و دکتری چیست و کدام دانشگاه های کشور مبادرت به پذیرش دانشجو در مقاطع بالای این رشته کرده اند؟
درمقاطع کارشناسی ارشد و دکتری اصلاح نباتات چندین گرایش مثل اصلاح نباتات کلاسیک،اصلاح نباتات کاربردی، بیوتکنولوژی، مهندسی ژنتیک، بیوانفورماتیک و... راه اندازی شده و در آینده نیز گرایش ها و انشعابات جدید در دنیا بوجود خواهد آمد که در هر جامعه ای متناسب با نیازهای آن جامعه، فارغ التحصیلان مربوطه مشغول خدمت خواهند شد، در ایران هم تعدادی از دانشکده های کشاورزی رشته اصلاح نباتات را در سطح کارشناسی ارشد و دکتری دارند که روز به روز به تعداد آن ها افزوده می شود. در دانشگاه شهید چمران نیز در خواست مدیریت محترم دانشگاه به وزارت علوم، تحقیقات و فن آوری برای راه اندازی رشته اصلاح نباتات در مقطع کارشناسی ارشد ارسال شده که امید است در آینده نزدیک مجوز راه اندازی این رشته صادر شود.
فرق اصلاح نباتات با بیوتکنولوژی در چیست ؟
اصلاح نباتات شامل روش های کلاسیک و کار بردی است که برای اصلاح گیاهان از نظر بسیاری از صفات ( چه کیفی و تک ژنی و چه چند ژنی ) به کار می رود و سابقه خیلی طولانی تری دارد، درحالیکه بیوتکنولوژی گیاهی علم جدیدی است که از شاخه ژنتیک مولکولی و بیوشیمیایی که محور کار آن تک ژنها و اثرات آنها ( بیشتر به صورت خصوصیات کیفی تک ژنی ) بوده و درمورد صفات چند ژنی هنوز باید تلاش های زیادی توسط محققین بیوتکنولوژی صورت گیرد. البته بیوتکنولوژی مکمل اصلاح نباتات است وبرای رسیدن به نتیجه مطمئن نهایی، مخصصین هر دو گرایش باید با هم تشریک مساعی کنند. با توجه به نیاز کشور ، هر دو این گرایش ها بسیار مفید هستند ولی شاید ادامه تحصیل در رشته بیوتکنولوژی و فعالیتهای تحقیقاتی در این گرایش بخاطر پر هزینه بودن و امکانات مورد نیاز اختصاصی ، فعلاً در همه دانشگده های کشاورزی امکان پذیر نباشد .
موقعیت شغلی رشته اصلاح نباتات و گرایش های وابسته به آن در جامعه ما چگونه است و چه سازمانهای فارغ التحصیلان این رشته را استخدام می کنند؟
در حال حاضر فارغ التحصیلان رشته اصلاح نباتات عمدتا در مرکز تحققات جهاد کشاورزی مثل موسسه اصلاح بذور یا مراکز اصلاح گیاهان زراعی محدودی ( چغندر قند، غلات، خرما، نیشکر، برنج، و دانه های روغنی ) جذب شده اند و با زیاد شدن فارغ التحصیلان این رشته لازم است توجه به بخش خصوصی و سرمایه داران به مزایا و منافع سرمایه گذاری در این زمینه جمع شود . هر چند رسیدن به مرحله سود آوری در این رشته نسبت به صنعت و امور خدماتی و واسطه گری دیرتر حاصل می شودولی منافع آن سرشار بوده و رشته ای با برکت و خدا پسندانه است . در کشورهای پیشرفته در امر کشاورزی، بخش خصوصی نقش بسیار حیاتی در تولید ارقام اصلاح شده و گیاهان هیبرید دارند.
شما به عنوان یک استاد و پیش کسوت در این رشته چه انتظاری از دانشجویان دارید؟
... از دانشجویانی هم که مایل به ادامه تحصیل در رشته اصلاح نباتات هستند انتظار دارم تمام دروس خود، مخصوصاً دروس زمینه اصلاح نباتات را با جدیت و عمق بیشتری فرابگیرند و فقط به گذراندن این دروس و کسب نمره قبولی اکتفا نکنند. در صورت امکان از دروس «پروژه» و «عملیات دروس» و امکانات آزمایشگاه های مربوطه حداکثر استفاده را در کسب تجربیات عملی ببرند.
سايت زير در برداردندة كنگره ها و سمپوزيوم ها و همايش هاي داخل كشور است كه برگزار شده يا خواهند شد:
--------------------------------------------
ديگر همايش ها و ...:
هشتمین کنگره بین المللی گندم-روسیه-خرداد 1389 - www.8iwc.org
پنجمين همايش آمار ايران-پيام نور- دانشگاه پيام نور مركز تويسركان - اول اسفند ۱۳۸۸
سومین همایش ملی حبوبات ایران 29 و 30 اردیبهشت 1389، کرمانشاه- سازمان جهاد کشاورزی
http://biotechnews.ir/html/index.php?name=News&file=article&sid=163&theme=Printer
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
یازدهمین کنگره ژنتیک ایران
انجمن ژنتیک ایران، یازدهمین کنگره ژنتیک ایران را در زمینه های ژنتیک مندلی، ملکولی، کمی و جمعیت، سیتوژنتیک، ژنومیکس و پروتئومکس، ژنتیک و متابولیسم و تنوع و تکامل ژنتیکی، از 29 تا 31 اردیبهشت ماه سال 1389 در دانشگاه تربیت مدرس تهران برگزار می نماید.
--------------------------------------------------------------------------------------------------
یازدهمین کنگره علوم زراعت و اصلاح نباتات ایران
فراخوان کنگره
با استعانت از پروردگار متعال، یازدهمین کنگره علوم زراعت و اصلاح نباتات ایران با شعار تولید پایدار زراعی و امنیت غذایی توسط انجمن علوم زراعت و اصلاح نباتات ایران و دانشگاه شهید بهشتی در تاریخ 2 تا 4 مرداد ماه سال 1389 در محل دانشگاه شهیدبهشتی تهران، با اهداف و زمینه های تخصصی زیر برگزار می شود.
http://congress.agrobreed.org/
تاریخ برگزاری کنگره 2 الی 4 مرداد ماه 1389
آخرین مهلت ثبت نام و ارسال مقاله بدون تاخیر 30 دی 1388
آخرین مهلت ثبت نام و ارسال مقاله با تاخیر 15 بهمن ماه 1388
http://congress.agrobreed.org/ConferenceAnnouncement.aspx
--------------------------------------------------------
همایش ملی حبوبات- کرج
http://www.persiangig.com/pages/download/?dl=http://abeyran.persiangig.com/%d9%81%d8%b1%d8%a7%d8%ae%d9%88%d8%a7%d9%86%20%d9%86%d9%87%d8%a7%d9%8a%d9%8a%20%d9%87%d9%85%d8%a7%d9%8a%d8%b4%20%20%d9%85%d9%84%d9%8a%20%d8%ad%d8%a8%d9%88%d8%a8%d8%a7%d8%aa.pdf
----------------------------------------------------------------------------------------------------------
سمپوزيوم بين المللي ژنتيك برنج سمپوزيوم كاربردي آمار چهاردهمين كنفرانس بين المللي اصلاح نباتات بيست و پنجمين سمپوزيوم زيست شناسي گياهي كنفرانس بين الملل مقاومت به تنش هاي غيرزنده گياهي هفتمين كنگره بين المللي زيست فنآوري گياهي كنفرانس هاي بيوتكنولوژي در دنيا--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
http://www.allconferences.com/Agriculture Conferences Worldwide
http://www.conferencealerts.com/agri.htm
:3rd Annual International Symposium on Agricultural Research
http://www.allconferences.com/conferences/2009/20090902055130
http://www.cab2010.org/ 11th Computer applications in biotechnology
http://www.ibs2010.org/ 14th International Biotechnology Symposium and Exhibtion
:3rd annul International Symposium on Agricultural Research
http://www.allconferences.com/conferences/2009/20090902055130
همچنين:
برای شروع و دستگرمی فعلاً با یک نرم افزار ساده ولی مهم و عجیب که همه ما به آن نیاز داریم ولی از آن اطلاع نداریم شروع میکنم. اسم این برنامه MathType نام دارد. این برنامه در کنار Microsoft office Word همانند اسیستانت ویندوز به کاربران Word کمک مینماید تا فرمولهایشان را به نحو بهتر و با دست بازتر در برنامه Word بنویسند. زیراکه فرمولهای Word محدود بوده ودر قسمت Equation Editor قرار دارند. این برنامه (ورژن 6 بنام MathType_6_full.rar) را از اینجا و یا از سایت www.4shared.com بگیرید و نصب نمایید. سایت سازنده برنامه اینه: http://www.dessci.com/en/products/mathtype که البته به شما ورژن کامل رو نمیده و لی ما میدیم. برای نصب حتماً از برنامه همراه آن یا KeyMaker استفاده کرده و Code لازم را تولید (Generate) و در محل مناسب حین اجرا کپی کرده تا برنامه بصورت Full نصب شود وگرنه جواب نمیدهد. این برنامه تا جایی که بررسی شد معروفترین و کاملترین برنامه های ویرایش معادله است که با اکثر محیطها سازگاری داشته و میتوان فرمولهای تولید شده در آن را به هرجایی مثل وورد یا پاورپوینت و غیره منتقل یا paste نمود. حتماً یادتون باشه که قبل از اتمام و بستن فایل Wordتان آن را در هر دو برنامةWord و Mathtype ذخیره نمایید. که البته از شما در حین بستن فایلها میپرسد. از این همه مطالب که گفتم وحشت نکنید زیرا موقع کار با این نرم افزار میبینید که هیچ کاری نداره. کاری ندارید؟. خداحافظ.
Matrice Operations in MINITAB software
فايل زير حاوي آنچه لازم است در خصوص عمليات ماتريسي يا محاسبات ماتريسي با نرم افزار ميني تب بدانيد و عمل كنيد. البته لازم به ذکر است که minitab به صورت معمول قادر به محاسبه دترمینان یک ماتریس مربعی نمی باشد ولی به لطف برنامه ای که ما برای مینی تب نوشته ایم این کار به سهولت در این نرم افزار انجام پذیر است. http://abeyran.googlepages.com/Minitab_Matrice_Operation.doc
تجزیه علیت یا تجزیه مسیر با مینی تب
Path Coefficient Analysis via MINITAB
بحث تجزیه علیت یکی از مهمترین و پراستفاده ترین مسائل علوم مختلف بخصوص کشاورزی و بیولوژی بو انسانی بوده و به کرات استفاده می شود. برای دیدن مقاله های این علم به آدرس www.sid.ir مراجعه شود.
برای انجام تجزیه علیت نرم افزارهای متعددی وجود دارد ولی هیچ کدام به اندازه برنامه ای که در اینجا معرفی می گردد کامل و پرمحتوا نیستند. زیرا برنامه ی ما تجزیه مذکور را به صورت چندمتغیره انجام میدهد.برای اطلاعات بیشتر و دانلود مقاله ی این برنامه به ژورنال: Journal of Crop Improvement, Volume 22, Issue 1 May 2008 , pages 82 - 120، مراجعه کنید. همچنین برای گرفتن کد (اصل) برنامه به اینجانب E-mail بزنید (arminian_a@yahoo.com).
با توجه به محدوديت هايي كه جديداً براي دسترسي به تصاوير گوگل و ياهو در دانشگاه عزيز! ما پيش آمده از اين به بعد از تصاوير قدرتمند سايت هاي زير براي كار هاي تحقيقاتي تان بهره ببريد تا بينيم خدا چه فكري براي اين معضل خواهد كرد!.
- ليست كامل ژورنالهاي ISI و نيز اين سايت
- چند سايت جديد براي دانلود كتاب، دانلود مقاله، دانلود سمينار، دانلود پروژه: بنظرم مهمترين سايتها http://www.scribd.com و سپس http://www.4shared.com هستند. در سايت سكريبد بر خلاف گيگاپديا كه صرفاً مخصوص كتاب است، ميتوان، كتاب، مقاله، سمينار و ... را از يك تا چند هزار صفحه را در قالبهاي مختلف يافت. به سايت مذكور وارد و در Sign up ثبت نام كنيد. سپس مطلب را جستجو و بعد از ظهور آن به Download رفته و روي قسمت مورد نظر: (Microsoft Powerpoint (.ppt يا (Adobe Acrobat (.pdf يا حتي Excel ، راست كليك كرده و آن را با Save target as ذخيره كنيد. در اين سايت مي توانيد كتابها،مقالات و ... را بزبان فارسي نيز بيابيد. لذا بكمك Alt + Shift زبان نوشتار را به فارسي تبدبل كنيد.
- يك سايت خوب دانلود مطالب در فرم PPT ، PDF و غيره
۵-۲- يك سايت خوب ديگر مثل مورد ۵-
۵-۳- يك سايت خوب ديگر
۶- دانلود آموزش لهجه آمريكايي (انگليسي آمريكايي) كتاب ۱۸۵ صفحه اي با ۵ عدد CD
۷- جستجو درون سايت رپيدشير (RAPIDSHARE)
۸- برنامه آنلاين آماري ارزشمند (در ادامه مطالب بنام PBSTAT 1.01)
نكاتي چند!
۱- كاربر عزيزي از ما خواسته بود كه مطالبي يا فايلهايي را براي وي يافته و در بلاگمان بگذاريم. اولاٌ بايد پوزش بخواهم كه نتوانستم مطالب يافته شده را در جايي در اينترنت بگذارم. زيرا سايتي مثل 4shared هم بعد از يك ماه فايلها را حذف ميكند. در ضمن در دانشگاه گل و بلبل ما سرعت اينترنت تقريباٌ صفر است و نميتوان فايلي را تقريباٌ آپلود كرد. و درنهايت كاربران معظم ما بايستي بتوانند خودشان در اينترنت بهترين فايلها را يافته و در اختيار ديگران قرار دهند. و نه مثل بعضي از كاربران، آدرسهاي مفيد خودشونو با خود حمل و فقط خودشون استفاده كنند و بس!.
۲- دوم اينكه مراجعه كنندگان به سايت ما اكثراً هيچ نظر، انتقاد يا پيشنهادي ندارند!. اميد كه رضايت خاطرشان را جلب كرده باشيم.
شاد باشيد.
بعضي از خوانندگان محبوب از من خواسته اند كه بگويم كدام دانشگاه كشور درس ميخوانم!.
در اين رابطه بايد بگم بنده در يكي از دانشگاههاي مناطق محروم كشور درس ميخونم. در جايي كه فقط ستاره ها رو ميشه ديد و خداي ستاره ها رو!.
بگم كه عزيزان مهم نيست ما در كدام دانشگاه درس ميخونيم بلكه مهم اينه كه چطور ميخونيم و چقد از وقتمون استفاده مفيد ميكنيم. افرادي رو ديدم كه در گلهاي سرسبد دانشگاههاي كشور در پايتخت درس خوندند و هدفشون فقط كسب مدرك بود و اي دريغ كه حتي يك دستآورد نو يا مقاله آي.اس.آي هم ندادند. ولي افرادي در دورترين دانشكده هاي كشور به بهترين دستاوردها دست يافتند. و چه بسا دانشجوياني كه در همين مناطق همانند Gauss از آموزندگان خويش گوي سبقت را ربودند.
اميد كه نكته اي نو را دريابيم.
امروز بدليل استقبال مراجعين معزز از سايتم تصميم گرفتم دوباره مطالبي بهش اضافه كنم.
در سايتي كه معرفي ميكنم، ميتونيد تقريباً هر كتاب، مكتوب و مجلد ارزشمندي رو پيدا كنيد. بعضاً بعضي از شركتاي محترم اينكارو كرده و سي دي هايي تشكيل و به قيمت گزاف ميفروشند. يك نمونش:
مثلاً ميتوان كتاب تافل بارونز، ، TOEFL, BARRONS يا كتابهاي IELTS يا انواع فرهنگ لغت رو بهمراه فايلهاي صوتي اش بصورت MP3, CD, DVD دانلود كرد. حق داريد انتقاد كنيد كه كپي رايت رعايت نميشه. منهم مثل شما پايبند به اين حقم. البته اينو بگم كه اكثر انتشارات و مولفين در كتابهاشون اذعان دارن كه اگه هدف از دانلود يا كپي كتاب يا نرم افزاري شخصي و آنهم واسه دانشجوا باشه، مشكلي نيس.
واسه استفاده از سايت مذكور كه گيگاپديا نام داره بصورت زير عمل كنيد.
۱- ابتدا وارد سايت مذكور بنام Http://www.gigapedia.org شويد.
۲- سپس از طريق گزينه Register يا بعضاً Create يك شناسه يا ID و رمز عبور يا password ساختگي تشكيل بديد و اونو واسه هميشه يادداشت كنيد تا هميشه از طريق اون وارد بشيد.
۳- سپس از طريق Login با مشخصات خودتون همانند E-mail تون وارد بشيد و گرنه نميتونيد دسترسي پيدا كنيد.
۴- سپس در قسمت جستجو عبارت Item search رو تيك بزنيد
۵- حالا كتاب يا موضوعتون رو جستجو كنيد مثلا كتاب تافل 504 رو جستجو ميكنيم
اولين كتاب بنام زير ظاهر ميشه:
504Asolutely Essential Words - 3Ed
by: Murray Bromberg, Julius Liebb, Arthur Traiger
۶- حالا روي عنوان كتاب راست كليك كرده و Open in new window رو انتخاب كنيد
۷- در صفحه جديد روي Links كليك كنيد تا به مخزن يا مخازن حاوي كتاب دسترسي پيدا كنيد
۸- ممكن است يك كتاب از سايتش حذف شده باشه يا فقط در يك سايت يافت شه يا چند سايت مثل www.rapidshare.com , www.zshare.net , www.ifile.it , www.megaupload.com كه بهترين اونا ifile.it هست. دانلود از اكثرشون به سختي انجام ميشه. در سايت ifile.it يك يا چند بار بايستي بليط رزرو كنيد يا Request download ticket تا گزينه Download فعال بشه.
۹- بعد از دانلود فايل رو تست كنيد زيرا بعضي فايلا رمزعبور ميخوان كه اگه چنينه رمزو يادداشت و اصلاحش كنيد
نكته: زماني كه طبق توضيح فوق از مسير Links به آدرسها يا محلهاي ذخيره كتاب يا مجلد رسيديد مثل Rapidshare.com يا Ifile.it اگه كتاب رمز نياز داشته باشه در اونجا ذكر كرده كه مثلا: Password= gigapedia.org كه اكثر كتابها رمز عبورشون همينه. بهر حال رمز رو حتماً يادداشت كنيد.
البته جديداً اين سايت دچار تغييرات جزئيي شده كه خودتون راهشو خواهيد يافت!.
۱۰- از خوندن مطالب اين دنياي الكترونيك لذت ببريد
ولي بقصد تجارت و فروش آثار ديگران اين كارو نكنيد.
با سلام
در زير سايتي را مشاهده مي كنيد كه توسط آن مي توانيد پروتكلهاي فراواني را درخصوص بيوتكنولوژي پيدا كنيد. اينها بسيار مفيد هستند.
به عنوان مثال بعضي از اينها شامل موارد زيرند:
استخراج DNA از سلولهاي گياهي
استخراج RNA از سلولهاي گياهي
الكتروفورز ژل الكتروفورز
بافرها و محلولهاي استاندارد
الكتروفورز پروتئين
واكنش زنجيره اي پليمراز PCR
نورثرن بلات ، ساترن بلات و وسترن بلات و دهها پروتكل ديگر.
شاد باشيد
Statistical Methods for Agricultural Research
با اجازه كاربران عزيز آدرس كتابهايي بسيار مفيد را به همه دست اندركاران علوم كشاورزي تقديم مي كنم. در اين كتابها الكترونيكي همه مطلبي را درباره آمار، احتمالات، طرح آزمايشات و بيومتري مقدماتي و پيشرفته پيدا مي كنيد. اين كتابها محصول كشور هند اند.
http://www.iasri.res.in/ebook/EB_SMAR/index.htm
http://iasri.res.in/ebook/EBADAT/index.htm
سايت بسيار جالبي در خصوص آمار و نرم افزار هاي آماري و نرم افزار هاي رياضي
يا علي.
كتابها و نرم افزار هاي سيتوژنتيك: Cytogenetics books and softwares
در زمينه سيتوژنتيك ابتدا كتابهاي زير را دانلود كنيد. براي دانلود روي عنوان مربوطه كليك كنيد يا راست كليك و ذخيره كنيد.
دومين كتاب اصول سيتوژنتيك باليني با ۶۱۱ صفحه باmb ۸ حجم هست.
۱- بحث هايي در سيتوژنتيك- پروفسور چارلز بورنهام -۱۹۸۰
۲- اصول سيتوژنتيك باليني The principles of Clinical Cytogenetics - گرسن-۲۰۰۵
طراحي پرايمر و نرم افزار طراحي پرايمر:
Primer design, and a softwaer widely used for primer design
طرح PCR و توالي يابي پرايمرها، فعاليت هايي ضروري براي زيست شناسان مولكولي در سراسر جهان مي باشد (Rozen & Skaletsky, 2000). در اين بين پرايمرها، اجزاء ضروري سيستم هاي بر پايه PCR و همچنين سيستم هاي ريز آرايه (Microarray) مدرن بوده كه از پروب هاي مناسب استفاده نموده كه توسط تكثير با PCR بدست مي آيند (Yang et al., 2006).
امروزه در دنيا نرم افزار هاي متعددي براي طراحي پرايمر ساخته شده و حتي سايت هاي آنلايني موجود است كه به طراحي پرايمر كمك مي كنند. در اين بين نرم افزار پرايمر-۳ (Primer3) يكي از بهترين هاست. در اينجا ما اين نرم افزار را بهمراه معرفي يكي دو مورد ديگر و نيز حاوي چند مقاله مهم در اين خصوص و در رابطه با طراحي پرايمر و اصول آن آورده ايم. فايل هاي لازم در سه پرونده زيپ شده موجودند: پرونده Primer3-1.1.1-WINXP.zip شامل نرم افزار پرايمر-۳بوده كه از سايت نيز قابل دانلود است، و پرونده هاي Related papers-1.zip و Related papers-2.zip شامل مقاله هاي مربوطه و كار شده در اين رابطه مي باشند. تا چه قبول افتد و چه در نظر آيد.
http://abeyran.googlepages.com/Primer3-1.1.1-WINXP.zip
http://abeyran.googlepages.com/Primer-design-1.zip
http://abeyran.googlepages.com/Primer-design-2.zip
Yang et al., 2006. Recent developments in primer design for DNA polymorphism and mRNA profiling in higher plants. Plant Methods, Available from: http://www.plantmethods.com/content/2/1/4
نرمافزار MicroMeasure 3.3
به نقل از وبلاگ حسين زينل زاده ( و با تشكر از ايشان)
نرمافزار MicroMeasure طراحي شده توسط Aaron Reeves و Jim Tear (2000-1997) در گروه بيولوژي دانشگاه كلورادوي آمريكا جهت استفاده سيتولوژيستها و سيتوژنتيكدانان تهيه شده است.
اين نرمافزار يك برنامه آناليزكننده تصاوير ديجيتالي دريافتي از يك اسكنر يا انواع ميكروسكوپ نوري و الكتروني جهت محاسبه پارامترهاي كروموزومي از قبيل طول هر كروموزوم، طول بازوي بلند و كوتاه، نسبت بازو، شاخص سانترومري و ... و همچنين ساير ساختارهاي مرتبط بهكار ميرود. اين برنامه رايگان، سازگار با انواع ويندوزهاي مايكروسافت بوده و خروجي محاسبات را با استفاده از نرمافزار Excel نمايش ميدهد.
براي دريافت فايل و ضمايم شامل دو مقاله كار شده با اين برنامه روي اين لينك كليك كنيد.
۲- همچنين مي توانيد نرم افزارهاي(كاريوتايپينگ اتومات) سايت زير را گرفته و استفاده كرده و به ما هم اطلاع دهيد:
Karyotyping of plant chromosomes
فرهنگ جامع پزشكي آنلاين - Online Medical Dictionary
هرچه بخواهيد در اينجا تعربف آن را كامل به شما مي دهد:
http://cancerweb.ncl.ac.uk/cgi-bin/omd
آزمايشگاه سيتوژنتيك مولكولي و سيتولوژي
بروز شده در تاريخ ۸ بهمن ۸۶
۱- دانلود بهترين ها:
لينكهاي زير احتمالاً بهتريني باشند كه تا بحال در زمينه پيدا كردن نرم افزاري ديده ايد. همه چيز مجاني است. در اين سایتها بهترین نرم افزارهای کامپیوتري، آموزش، زبان ها، صوتی و تصویری، شغلي، ارتباطات، توسعه، آموزشي، بازي و نمايش، گرافيك، سرگرمي، اينترنت و شبكه، امنيت، سرور، سيستمها و ... براحتي قابل دسترسي اند.
http://www.bestfreewaredownload.com/
۲- ليست الفبايي نرمافزارهاي ژنتيك : Genetic Analysis Softwares
در سايت زير نرم افزارهاي مختلف آناليز ژنتيك را بيابيد.
آيا تاكنون توانسته ايد فايلهايتان را (كتاب، مقاله، فيلم و ويدئو، عكس، نرم افزار و ...) را بر روي اينترنت قرار داده تا همچنان كه شما از فايلهاي ديگران مفت و مجاني (عادت پسنديده ما ايرانيان!) استفاده ميكنيد، ديگران نيز از فايلهاي ارزشمند شما استفاده كنند. اصلاً آيا تا بحال شده كه مشكل كسي را بدين شيوه حل كنيد!.
در دنياي عظيم اينترنت سايتهايي وجود دارد كه شما ميتوانيد تقريباً همه چيز از آنها بگيريد. مثل سايت www.istgah.com خودمان كه از شير مرغ تا جون آدميزاد توش پيدا ميشه. شما ميتوانيد از كتاب و سي-دي گرفته تا گوسفند و حتي آپارتمان مسكوني از اين سايت بخريد.
به هر حال در سايتهاي خارجي نيز چنين هست. مثلاً سايتهاي زير. از اين سايتها ميتوانيد بهترين اطلاعات مثل كتاب و مقاله و فايلهاي رايانه و موبايل و ... بگيريد.
بهتر از طريق:
http://www.4shared.com/network/search.jsp
گرفتن اطلاعات از بعضي از اينها مثل چهارمی (rapidshare) سخت و پيچيده است و مشكل امنیتي دارد. ولي اولی تا سومی آسانتر و مجاني اند. نیز شما میتوانید فایلهایتان را در یک جای امن در http://pages.google.com قرار دهید.
دو مقاله بسيار معروف و پركاربرد در زمينه استخراج DNA گياهان: :Plant DNA extraction
M.G.Murray and W.F.Thompson. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA
Saghai-Maroof et al., 1984. Ribosomal DNA
مقاله اول به روش تامسون و مراي-۱۹۸۰ معروف است.
مقاله دوم نيز به روش سقايي- معروف و همكاران - ۱۹۸۴ معروف است.
****************************************
معرفی يک روش جديد، ساده و سريع استخراج DNA از بافت گياهی
A simple and fast novel method of plant DNA extraction
یک روش جدید، ساده و سریع استخراج DNA از بافت گیاهی جهت انجام واکنش زنجیره ای (PCR) به همت محققان پژوهشكده بيوتكنولوژي كشاورزي شمالغرب و غرب كشور (تبريز) معرفي شد.
مهندس احمد رزبان حقيقي محقق پژوهشكده بيوتكنولوژي كشاورزي تبريز در گفتگو با خبرنگار سرويس خبري ژنتيك و بيوتكنولوژي ايران اظهار داشت: "امروزه تکنیکهای مبتنی بر واکنش زنجیره ای پلیمراز، بطور گسترده ای برای تعیین تنوع ژنتیکی، شناسایی چند شکلیهای موجود در ژنوم و مکانهای کنترل کننده صفات کمی (QTL) و تعیین روابط فیلوژنتیکی در برنامه های اصلاح نباتات به کارمی رود. دراین راستا، استفاده از یک روش مناسب برای استخراج
DNAدرکوتاهترین زمان و با بهترین کیفیت ضروری است".
ايشان افزودند: "اکثرروشهای مختلف استخراج DNA ژنومی به خصوص درگیاهان بصرف زمان طولانی و با استفاده از مواد سمی از قبیل فنل انجام می گیرد. لذا هدف از این پژوهش ارائه یک روش سریع برای استخراج DNA با خلوص بالا میباشد. دراین روش DNA گیاه عدس، گندم و ریحان طبق روش (Dean Madden;2002) بابهینهسازی استخراج گردید. برای ارزیابی کیفیتDNA استخراج شده از الکتروفورز روی ژل و همچنین جهت ارزیابی موادممانعت کننده PCR، از تکنیک تکثیر به کمک آغازگرهای تصادفی ((RAPD بااستفاده از آغازگر OPC15 استفاده گردید. درنهایت نتایج نشان داد که این روش مناسب، کوتاه مدت و مقرون بهصرفه برای استخراج DNA از بافت گیاهی میباشد".
گفتني است نتايج اين تحقيق كه با همكاري دكتر حسن منيريفر، مهندس بيوك رئيسي، مهندس آرش جوانمرد، مهندس محمدرضا اعتمادي و دكتر عليرضا دهناد در پژوهكشده بيوتكنولوژي كشاورزي تبريزصورت گرفته در اولين كنفرانس بينالمللي علوم زيستي ايران در 23و24 آذر در دانشگاه آزاد اسلامي كرج ارائه گرديده است
لينك هاي اصلي خبر:
http://agri-research.persianblog.ir/1384_10_agri-research_archive.html#4489090
http://genetics.persianblog.ir/1384_10_genetics_archive.html#4489051
Ph.D dissertations
رساله هاي دكتراي تخصصي ( Ph.D dissertations ) را همه قبول دارند و مقاله هاي مستخرج از آنان را سريع چاپ ميكنند، زيرا محقق آنها زمان كافي براي تعميق موضوع را داشته است. ابتدا بهتر است با شيوه نگارش رساله هاي دكتري آشنا شويم. براي اين به دو سايت زير مراجعه نماييد:
http://members.verizon.net/~vze3fs8i/air/airphd.html how to write a Ph.D thesis
http://writing-services.org/blog/2007/10/29/phd-dissertation-writing/
و اكنون در سايت هاي زير ميتوانيد بسياري از رساله هاي دكتراي تخصصي (در قالب PDF) يافته و از آنها لذت ببريد:
http://www2.acs.ncsu.edu/grad/ETD
http://rudar.ruc.dk/handle/1800/2404
http://library.stanford.edu/africa/theses.html
http://www.nscl.msu.edu/ourlab/publications/year
http://www.csg.ethz.ch/research/dissertation_prj
http://edt.missouri.edu/browse.php?meth=1
http://eprints.hec.gov.pk/view/year
http://eprints.usq.edu.au/view/for08
http://bpt.hec.gov.pk/view/subjects
آمار و طرح آزمايشات
برای گرفتن کتابها و مطالب آمار ساده، چند متغیره و طرح آزمایشات به سایتهای زیر بروید:
http://psych.colorado.edu/~carey/Courses/PSYC7291/ClassHandouts.htm
http://www2.chass.ncsu.edu/garson/pa765/links.htm
دستور کار نرم افزار آماری SAS user`s Guide
به اطلاع عزيزاني كه دستي در آمار و طرح آزمايشات دارند مي رسانيم، كتاب ارزشمند فوق را مي توانيد (در ۷۲ فصل و در حدود ۴۰۰۰صفحه pdf) در سايت هاي زير بيابيد و پرينت بگيريد. موفق باشيد.
http://abeyran.googlepages.com/Chps-1-20.zip
http://abeyran.googlepages.com/Chps-21-25.zip
http://abeyran.googlepages.com/Chps-26-30.zip
http://abeyran.googlepages.com/Chps-31-40.zip
http://abeyran.googlepages.com/Chps-41-60.zip
http://abeyran.googlepages.com/Chps-61-70.zip
http://www2.stat.unibo.it/ManualiSas
همچنين براي استفاده از جداول توزيعهاي آماري (Z, t, Binomial etc) به اينجا مراجعه كنيد:
http://www.statsoft.com/textbook/sttable.html
http://fsweb.berry.edu/academic/education/vbissonnette/tables/tables.html
يافتن ريشه معادلات خطي تا درجه ۴ بصورت آنلاين:
Root-finding Routines
http://www.akiti.ca/Mathfxns.html
ژورنالهای علمی وپژوهشی
Scientific research journals
چند سايت حاوي ژورنالهای مهم جهت استفاده دانشجويان رشته های مختلف (بخصوص اصلاح نباتات)
در ذيل ارائه ميگرد .در اين ژورنالها مي توان مثلاً مقاله هاي سالهاي ۱۹۱۵ لغايت ۲۰۰۷ را رايگان دريافت کنيد. در هر ژورنال دو قسمت وجود دارد: يكي قسمت جستجو يا سرچ و ديگري آرشيو سالها. بعنوان مثال ميتوان 2 مقاله اوريجينال توالي يابي DNA "ماکزام و گيلبرت" و "سانگر و کولسون" را (۱۹۷۵)در ژورنال www.pnas.org پيدا نمود.
استفاده يا نقل مطلب از اين بخش فقط با ذکر منبع مجاز است.
Dear colleagues, Some of the best research journals and magazines
:is introduced here, hope they will be suitable and helpfull
http://www.nature.com/index.html Nature, IF=31.354
http://www.nature.com/nbt/index.html Nature Biotechnology, IF=22.7,
http://www.newscientist.com/home.ns New Scientist magazine
http://www.sciencemag.org Science magazine
http://www.msrt.gov.ir/Temp/nashriyeh.ht Iranian journals list
http://www.e-journals.org/ Foreign Journals list
http://www.jstage.jst.go.jp/browse/ Japan free journals
http://www.doaj.org Directory of Open Access Journals
http://www.oxfordjournals.org Oxford journals
http://journals.cambridge.org Cambridge journals
http://www.promega.com Promega USA
http://arjournals.annualreviews.org/ A nnual Reviews
http://www.sciencedirect.com/ Science direct
http://en.wikipedia.org Wikipedia Free Encyclopedia
http://www.springer.com/east/home?SGWID=5-102-0-0-0 Springer journals
http://www.elsevier.com Elsevier journals
http://www.pnas.org Proc Natl Acad USA, IF=9.64 & $70 per page
http://nar.oxfordjournals.org Nucleic Acid Researches, IF=6.317 & $1250per article
http://www.springerlink.com/content/1432-2242/ Theoretical Applied Genet (TAG), IF=2.715http://crop.scijournals.org Crop Science, IF=0.828(2003)
http://plantphysiol.org Plant physiology, IF=3.825 & $75 for first 10 pages
http://www.nature.com/hdy/index.html Heredity IF=2.872,
http://agron.scijournals.org Agronomy IF=1.272, $700 at least per paper
http://www.scielo.br Brazilian Journals
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_serial&pid=1677-0420&lng=en&nrm=iso Brazilian J. Plant Physiol
http://www.genetics.org Genetics
http://www.plantcell.org Plant Cell, IF=9.852, & $75 per page.
http://jxb.oxfordjournals.org Exp. Bot. Oxford Univ.
http://aob.oxfordjournals.org Annals of Botany IF= 2.448, No charge need
http://mistug.tubitak.gov.tr/bdyim Turkish J. of Botany & Biology etc
http://www.pjbs.org Pakistan J. of Biological Sciences
http://ansijournals.com Asian Scientific Informations
http://www.blackwell-synergy.com Blackwell
http://www.blackwell-synergy.com/loi/nph New Phytologist, IF=4.245, $2600
http://www.blackwell-synergy.com/loi/mpp Plant Pathology
http://www.blackwell-synergy.com/loi/gtc Genes to Cells
http://www.blackwell-synergy.com/loi/pbi Plant Biotechnology, IF=3.378, $2600(?)per paper
http://www.nature.com/hdy/index.html Heredity
http://www.springerlink.com/content/102881/ Euphytica
http://genomebiology.com/ Genome Biology
http://www.molplantbreed.org/default.asp Molecular Plant Breeding
Other Journals:
http://genomebiology.com/ Genome Biology, IF=7.17
http://www.blackwellpublishing.com/aims.asp?ref=0140-7791&site=1 Plant, Cell & Environment, IF=4.135
http://www.springer.com/west/home/physics?SGWID=4-10100-70-35733903-0 Photosynthesis research, IF=2.193
http://www.blackwellpublishing.com/journal.asp?ref=0960-7412 Plant journal, IF= 6.565
http://www.blackwell-synergy.com/loi/ppl?cookieSet=1 Physiologia plantarum, IF-= 2.169
http://www.springerlink.com/content/0032-0935 Planta, IF=3.318
http://pcp.oxfordjournals.org/ Plant and Cell Physiology, IF= 3.324
http://www.springerlink.com/content/0721-7714 Plant Cell Reports, IF=1.727
http://biostatistics.oxfordjournals.org/ J. of Biostatistics, IF=3.012
http://www.publish.csiro.au/nid/17.htm Australian journals
http://www.publish.csiro.au/nid/40.htm Australian J. Agr. Res., IF=1.133
http://www.publish.csiro.au/nid/65.htm Australian J. Bot., IF=0.940
http://www.publish.csiro.au/nid/102.htm Functional Plant Biology IF=2.272http://www.blackwellpublishing.com/journal.asp?ref=0931-2250&site=1 J. Agr Crop Sci. IF=1.046
European Journal of Agronomy IP=2.376 http://www.sciencedirect.com/science/journal/11610301
Photosynthetica IP=1.0 http://www.springer.com/life+sci/plant+sciences/journal/11099?detailsPage=description
American J. of Botany IP>2.50 http://www.amjbot.org
Functional Plant Biology IP=2.** http://www.publish.csiro.au/?nid=102
Acta Physiologiae Plantarum IP=0.80. http://www.springerlink.com/content/0137-5881
International Journal of Plant Production IP= ?? http://www.gau.ac.ir/ijpp/Guide4Authors.aspx
Heredity IP=3.823 http://www.nature.com/hdy/index.html
Field Crops Research IP=2.032 http://www.sciencedirect.com/science/journal/03784290 ""free of page charges""
Plant Breeding http://www3.interscience.wiley.com/journal/117977123/home/ForAuthors.html
Physiologia Plantarum IP=2.334 http://www.wiley.com/bw/journal.asp?ref=0031-9317 Six printed pages are free of charge
Photosynthesis Research IP=2.681 http://www.springerlink.com/content/100325/
Journal of Plant Physiology http://shop.elsevier.de/jpp
Journal of Cereal Science IP=3.026 http://www.sciencedirect.com/science/journal/07335210
Cereal Research Communications IP=1.190 http://www.akkrt.hu/main.php?folderID=1575&articleID=4540&ctag=articlelist&iid=1
IF نكته: جهت مشاهده ليست كامل مقالات آي.اس.آي و
آنها در سال ۲۰۰۷ اينجا كليك كنيد.
نرم افزارهاي آماري ، طرح آزمايشي و عمومي
Applicable interactive softwares
Free Statistics/Genetics softwares:
http://freestatistics.altervista.org/en/stat.php
http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_statistical_packages#Freeware
http://www.math.yorku.ca/SCS/StatResource.html
......
PBSTAT 1.01 : يك نرم افزار (برنامه) آنلاين براي انجام تجزيه واريانس مركب، برآورد وراثت پذيري عمومي و رگرسيون پايداري بروش فينلي-ويلكينسون Finlay-Wilkinson:
PBSTAT 1.01: A WEB-BASED STATISTICAL ANALYSIS SOFTWARE FOR PARTICIPATORY PLANT BREEDING
مقاله اين برنامه آماري و بيخطرتر از مورچه در سايت زير موجود است هرچند بدليل صدماتي كه به كشور ميزند آن را بلوكه كرده اند !!!.
http://willy.situshijau.co.id/downloads/icoms3-pbstat
......
دانلود نرم افزار ميني تب MINITAB:
دانلود ميني تب نسخه 13
Download MINITAB13
http://abeyran.googlepages.com/MTB-13-1.rar
http://abeyran.googlepages.com/MTB-13-2.rar
دانلود ميني تب نسخه 15
Download MINITAB15
http://bdfp.persianblog.ir/post/46
........
دانلود نرم افزار هاي نقشه يابي ژنتيكي:
:Genetics mapping softwares
http://www.mapmanager.org/qtsoftware.html
http://www.msu.edu/~freed/disks.htm
http:/www.spss.com/amos/
http://www.sas.com/technologies/analytics/statistics/stat/index.html/
http://www.ssicentral.com/
http://www.mvsoft.com/
http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3/
http://lbm.ab.a.u-tokyo.ac.jp/~ukai/front.html
http://www.statsoft.com/
http://statpages.org/javasta2.html
http://journalseek.net/index.htm
http://www.verypdf.com/download/download.htm
Folder lock protects your folders:
واژه نامه ها، مقالات ، معرفی کتب و سایتهای مرتبط:
ژنتیک- بیوتکنولوژی، - ژن - کروموزوم - ژن درمانی - DNA - سلولهای بنیادی -
| اصلاح نباتات با منشا ژنتیک ، به تغییرات جهتدار و مفید در بنیان ژنومی گیاهی اطلاق میشود و منظور از مفید بودن صفات جدید ، سازش بیشتر با محیط و رفع نیازمندیها میباشد. |
مقدمه
|
۱- دوره اول: در این دوره انسان بدون شناخت نظام تولید مثل گیاهان ، برای اولین بار به کشت و تولید مصنوعی گیاهان تحت شرایط کنترل شده اقدام نمود. در این دوره انسان ، گیاهان برتر و مطلوب را ذخیره و نگهداری میکرد و به این ترتیب عمل انتخاب ناخود آگاه صورت گرفت. با مرور زمان اهلی کردن حیونات نیز آغاز شد بنابراین کشت گیاهان همراه با اهلی نمودن دامها انجام شد.
۲- دوره دوم: در این دوره انسان به نظام تولید مثل گیاهان پی برد و به آمیزش گونههای مختلف گیاهان پرداخت. اما هنوز اصول علمی ژنتیک کشف نشده بود و تلاقی گونهها بطور تصادفی و به عنوان یک نوع هنر صورت میگرفت....
ادامه مطلب
استفاده از روشهاي كلاسيك و نوين اصلاح نباتات
در بهبود عملكرد
Using classical and modern plant breeding approches for yield improvement
بيوک رئيسي
پژوهشکده بيوتکنولوژي کشاورزي شمالغرب و غرب کشور
منبع: http://www.parsbiology.com/discuss/article.aspx?AID=58&TID=10
اصلاح نباتات :
اهلي نمودن گياهان يكي از مهمترين وقايع كشاورزي در دنياي جديد است. هدفهاي كلي اصلاح نباتات افزايش عملكرد در واحد سطح بهتر نمودن كيفيت محصولات كشاورزي و توليد مواد اوليه مورد نياز جوامع انساني است. ارقام و واريتههاي اصلاح شده گياهان زراعي و زينتي هر ساله از كشوري به كشور ديگر انتقال داده ميشود. بدين طريق كيفيت و كميت محصولات كشاورزي افزايش يافته و احتياجات فراوردههاي زراعي رفع ميشود. در اغلب گياهان يك يا چند ژن باارزش اقتصادي فراوان دارد. ژنهايي كه حساسيت و مقاومت گياهان را نسبت به امراض و آفات كنترل ميكنند در اولويت برنامههاي اصلاح نباتات قرار دارند. هدف اصلاحگر نبات نبايد در توسعه روشهاي معمول كشت نباتات اصلاحي منحصر گردد بلكه بايستي همواره در جستجوي تركيبات نو از ژنوتيپهاي مطلوب باشد.
هدف اصلاحي نهايي در هر برنامه اصلاحي افزايش عملكرد ميباشد. در شرايط نا مساعد افزايش عملكرد به طريق اصلاح نباتات به مقدار كم و صرف زمان طولاني ممكن است ژنهاي كنترل كننده عملكرد براي بروز حداكثر پتانسيل خود به عوامل محيطي توليد وابسته ميباشند. به طور كلي عمدترين اهداف اصلاح نباتات را ميتوان در عناوين زير خلاصه ميشود.
۱- بهبود كيفيت
كيفيت خصوصيتي است كه باعث افزايش ارزش محصول ميشود كيفيت در جائي ممكن است به ارزش غذايي يك غله يا طعم و بافت يك ميوه تلقي شود. كيفيت جزء مهمي از هر برنامه اصلاح نباتات محسوب ميشود. به عنوان مثال ژنوتيپهاي مختلف گندم آرد توليدي حاصل از آن را تحت تاثير قرار داده و نهايتاً حجم و بافت و رنگ نان را مستقيماً تحت تاثير قرار ميدهد. بهرحال در گياه اصلاح شده از لحاظ پروتئين و اسيدهاي آمينه ممكن است متفاوت باشد. در اهداف توليد نباتات علوفهاي توجه به كيفيت علوفه همواره مسئله خوشخوراكي و ارزش تغذيهاي را در بردارد در گياهان زينتي كيفيت مفهومي جدا از گياهان زراعي دارد. خصوصيات كيفي در گلهاي زينتي عمدتاً همچون شكل ظاهر، شدت و ميزان عطر ساطع شده و وجود و عدم وجود تيغ، تعداد گلبرگ را شامل مي شود. در ميوه ها و محصولات انباري كه طيف وسيعي از ميوه جات و سبزيجات را در بر مي گيرد كيفيت معمولاًَ به مقاوم و ماندگاري خصوصيات بيوشيميايي محصول انبار شده در برابر تغييرات طولاني مدت محيط فيزيكي را شامل مي شود. خصوصيات انباري از مهمترين شاخصهاي اقتصادي را شامل مي شودكه با بازار پسندي محصول ارتباط مستقيمي دارد.
۲- افزايش توليد در واحد سطح:
ادامه در صفحه بعد:
ادامه مطلب
اهميت بيوتكنولوژي گياهي و حوزههاي مختلف كاربرد آن
به نقل از: محمدمير، ۶/۶/۱۳۸۱: http://bio.itan.ir/?ID=220
ابعاد اقتصادي بيوتكنولوژي در حوزه كشاورزي
حوزههاي مختلف بيوتكنولوژي گياهي نوين
الف) مهندسي ژنتيك و ديانآي نوتركيب
گياهان تراريخته و اهميت اقتصادي آنها
مثالهايي از كاهش خسارات آفات
زمينههاي مختلف كاربرد گياهان تراريخته
ب) كاربرد نشانگرهاي مولكولي
ج) كشت سلولها و بافتهاي گياهي
برخي كاربردهاي كشت بافت گياهي
مقدمه
بر اساس گزارشات سازمان ملل، حدود 800 ميليون نفر از جمعيت جهان (14 درصد) دچار فقر غذايي هستند كه تا سال 2020 به يك ميليارد نفر خواهند رسيد. تخريب روزافزون جنگلها، مراتع و فضاي سبز، گسترش بيابانها، نابودي گونههاي متنوع گياهي و جانوري، مقاوم شدن آفات و عوامل بيماريزا به سموم و بروز بسياري مسائل جدي ديگر هر روز ابعاد گستردهتري مييابد.
.............
به ادامه مطلب برويد...
ادامه مطلب
نشانگرهای مولکولی در اصلاح نباتات
مثل RAPD , AFLP , SSR
Molecular Markers in Plant Breeding
http://library.wur.nl/wda/dissertations/dis2769.pdf
:And
http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-02212006-112610/unrestricted/00front.pdf
كاربردهاي بيوتكنولوژي در ژنتيك و اصلاح دام
آرش جوانمرد
فارغ التحصیل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دانشگاه تهران
منبع: http://www.parsbiology.com/discuss/article.aspx?AID=56&TID=4
بيوتكنولوژي يا فنآوري زيستي، كه به صورت توانائي بكارگيري فرآيندهاي زيستي در بعد صنعتي تعريف ميشود در دو دههِ گذشته، كاربردهاي گستردهاي در عرصه هاي كشاورزي وبهداشت، محيط زيست و غيره يافته است.
بيوتكنولوژي در مفهوم عام و نزد اكثريت مردم معناي درآمد بي دردسر را تداعي نموده است و در دههِ اخير اين كلمه را غالبا به مفهوم همه چيز براي همهِ مردم كار مي برند.
تاريخچه بيوتكنولوژي نشان مي هد كه سابقه استفاده از آن به 8 هزار سال قبل مي رسد. درزمان سومريان و روميها از ميكروارگانيزمها استفاده ميكردند. حتي در جنگ جهاني نيز آلمانها كه ازواردات گليسرول براي تهيه مادهِ منفجره نااميد شده بودند از راه توليد ميكروبي از مخمر به گليسرول رسيدند
از دهه1980، بيوتكنولوژي زمينهِ جديدي را براي رشد پيدا نمود كهاين تغيير مرهون پيشرفتي است كه حاصل فنآوري برش و اتصال مولكولDNA به صورت دلخواه ميباشد. اكنون اين تفكر كه بيوتكنولوژي با تكيه بر دستاوردهاي مهندسي ژنتيك قادر است منافع عظيمي را نصيب بشريت نمايند، به شدت تقويت يافته است.
مهندسي ژنتيك در واقع انقلاب عظيمي را در علوم زيستي به وجود آوردهو با سابقهِ كوتاه قريب بيست سال، سرشار از نتايج مثبت است. تحليلگران آگاه قرن آينده را قرن امپراطوري مهندسي ژنتيك، كامپيوتر و ليزر ناميدهاند. امروزه در اثر مطالعات عميق و بررسيهاي ژرف مرزهاي ژنتيك مولكولي و يافته هاي مربوطه شناخت ژنها به گونهاي دور از تصور گسترش يافته و حجم اطاعات حاصله و رشد روزافزون آن قابل مقايسه با هيچ دوراني نمي باشد. نمودار زير به بعضي ازتوانمنديهاي بيوتكنولوژي در علوم مختلف اشاره مي كند:
ژن درماني
ژن درماني اصلاح يك اشتباه متابوليسمي مادرزادي با وارد كردن يك ژن طبيعي در فرد مبتلاميباشد. البته در مورد جانوران اشتياق زيادي براي زنده نگاه داشتن مبتلايان به بيماريهاي شديد وسخت ژنتيكي وجود ندارد.
اخيراإ روش انتقال ژنها در داخل سلول نطفهاي موش به منظور رفع يك نقص ژنتيكي موردتجربه قرار گرفته است. در اين تجربه ملكولهايDNA را كه شامل رديف كددار براي سنتز پروتئينآزاد كنندهِ گونادوتروپين(Ghrh)هستند، بداخل هسته تخمك بارور موشهائي كه مبتلا به كمكاري موروثي غدد جنسي بودند تزريق نمودند. ژن تزريق شده در هيپوتالاموس تعدادي از موشهايتوليد شده، فعال گرديد و رمز خود را در راه سنتز هورمون نامبرده بيان داشت. بعلاوه فعاليت ژنبطور طبيعي تحت اثر سيستم تنظيم كننده قرار گرفته و حيوان از هر لحاظ طبيعي بوده است. از اينگذشته در نسلهاي بعدي حيوان نيز اثري دال بر كمبودGhrh مشاهده نشده است.
متخصصان اصلاح نژاد ...
ادامه مطلب
بروز شده در ۸/۱۱/۸۶
لطفاً روی سايتهاي زير کليک کنيد:
توابع نقشه يابي (هالدين و كوزامبي):
http://www.ndsu.edu/ndsu/abergstr/webcourses/genetics/mf/mf02.htm
http://www.stat.wisc.edu/~yandell/statgen/reference/qtl.html
براي گرفتن نرم افزار هاي مربوطه به سايتهاي زير برويد:
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software
http://www.broad.mit.edu/ftp/distribution/software
:Softwares for Molecular Markers & QTL Analyses
Statistical Genetics: Gene Mapping Through Linkage and Association
***************************
چند مقاله فارسي در زمينه نقشه يابي QTL :
لازم به ذكر است كه اين مقاله ها در مجله علوم كشاورزي ايران-كرج چاپ شده و بصورت آنلاين و مجاني قابل دسترسي اند.
۱- نقشه يابي QTL ها در گندم QTL mapping of wheat (Triticum aestivum
http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi1.zip
۲ - نقشه يابي QTL ها در گندم QTL mapping of wheat (Triticum aestivum
http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi2.zip
۳- ترسيم نقشه ژنتيكي جو با AFLP mapping of Barley using AFLP (Hordeum vulgare AFLP
http://abeyran.googlepages.com/BarleymappingviaAFLP-farsi.zip
4- نقشه يابي QTL هاي روغن در كلزا QTL mapping of Canola oil (Brassica napus
http://abeyran.googlepages.com/QTLcanola-farsi.zip
۵- آناليز ژنتيکي و تعيين نقشه مولکولي QTL هاي مرتبط با مقاومت به خشکي در ذرت
انستيتو تحقيقات کشاورزي هند (پوسا) ـ دهلي
هدف از مطالعه فوق را مي توان در سه بخش خلاصه كرد:
الف) آناليز تنوع ژنتيکي در ژرم پلاسم ذرت براي مقاومت به خشکي و تشخيص لاين ها و هيبريد هاي مقاوم به خشکي.
ب) مطالعه پلي مورفيسم در لاين هاي مقاوم و حساس انتخابي.
ج) تعيين نقشه QTL هاي صفات مختلف مرتبط با خشکي.
آزمايش با استفاده از 76 اينبرد لاين مختلف در دو آزمايش جداگانه در سالهاي زراعي 2002-2001 و 2004-2003 در شهر حيدرآباد انجام گرفت و 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي در شرايط استرس خشکي و نرمال اندازه گيري گرديد. مطالعه فوق نشان داد که بسياري از لاين هاي مکزيکي و هندي در زمان گلدهي شديدا تحت تاثير خشکي واقع مي شوند. در مجموع 3 لاين از کشور هند IPA29B، FSA17 و CM140 و 10 لاين از سيميت به شرايط خشکي در زمان گلدهي مقاومت بسيار بالايي را نشان دادند. مطالعه پلي مورفيسم با استفاده از 12 لاين مختلف با واکنشهاي متفاوت به خشکي انجام گرفت. از مجموع 110 مارکر SSR، 71 مارکر پلي مورفيسم نشان دادند. در تحقيق فوق مجموعا 331 الل SSR و به طور متوسط 69/4 الل در هر لوکوس مشخص گرديد. در آناليزهاي Clustering،Bootstrap و Principal component، تعداد 4 کلاستر عمده تشخيص داده شد که به طور وضوح لاينهاي مقاوم به خشکي تامين شده توسط سيميت از بقيه لاين ها متمايز بودند.
براي تعيين نقشه QTL هاي مرتبط با صفات متاثر از خشکي در ذرت از لاين هاي نوترکيب Recombinant Inbred Line (RIL) استفاده شد. جمعيت فوق شامل 210 RIL Families است که از تلاقي دو لاين مقاوم (Ac7643) و حساس (Ac7729) به خشکي توليد شده اند. 210 لاين نو ترکيب فوق در قالب طرح آلفا لاتيس و در دو شهر کريم نگر(2003-2002) و حيدرآباد(2004-2003) و در فصل زمستان (فصل خشک) کشت و بعد از استرس خشکي، 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي يادداشت برداري شد. آناليز داده هاي فوق با استفاده از مدل Composite Interval Mapping منجر به تعيين 52QTL براي صفات مختلف در آزمايش کريم نگر (شامل 22 QTL در شرايط نرمال و 30 QTL در شرايط خشکي) و 14QTL در شرايط استرس خشکي در آزمايش حيدرآباد گرديد.
مقايسه نتايج حاصل از داده هاي حيدرآباد و کريم نگر وجود QTL هايي روي کروموزومهاي شماره 1، 2، 8 و 10 را مشخص نمود، که در شرايط استرس خشکي در هر دو ناحيه حيدرآباد و کريم نگر صفات بخصوصي را تحت تاثير قرار مي دهند. نتايج مشابه حاصل از مطالعه فوق با نتايج حاصل از مطالعات سيميت در مکزيک و کنيا روي لاين هاي نوترکيب يکسان QTL هاي عمومي را مکشوف مي سازد که ارزش بسيار بالايي در اصلاح ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي دارند. مطالعه فوق براي اولين بار در هند انجام مي گيرد و مي تواند نقش بسزايي در انتخاب، اصلاح و بهبود ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي و روش Marker Assisted Breeding به ارمغان آورد.
به نقل از http://sinaps-s.blogfa.com/86034.aspx
Bioinformatics
به نقل از سایت:
بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از کامپیوتر، نرمافزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی میگردد تا به مسائل بیولوژیکی بخصوص در زمینههای سلولی و ملکولی پاسخ داده شود. در این علم با بکارگیری کامپیوتر سعی میگردد تا تحقیقات وسیعتری در خصوص پروتئینها و ژنها بعمل آید.
دو فعالیت برجستهای که بیوانفورماتیک دانان به آن مشغول هستند پروتئومیک و ژنومیک میباشد.
ژنومیک شامل ...
ادامه مطلب
پروتئوميكس - Proteomics
براي آشنايي با پروتئوميكس به آدرسهاي زير مراجعه كنيد:
http://www.iupac.org/publications/pac/2004/pdf/7604x0829.pdf
http://bfgp.oxfordjournals.org
http://www.oardc.ohio-state.edu/tomato/Proteomics%20Presentation.pdf
دکتر مصطفی رونقی
..... علمی است در مورد ژنوم، درباره اين که ژنها چگونه بر يکديگر اثر می گذارند. ژنوم از .....

