* برای دانلود مقالات قدیم و جدید بصورت مجانی از ژورنالهای مهم و تامسون رویترز همانند کروپ ساینس و اگرونومی و ... به رمز عبور و پسورد نیاز دارید. شرکتها و افراد مختلفی این کار را پولکی با اخذ هزینه ی گزاف میکنند. ولی ما مجانی. ما که نه. در حقیقت سایت خوبم http://economicsphd.ir/f4 با ثبت نام.

* تعداد 198 جلد کتاب از مجموعه ی عظیم Methods in molecualr Biology از سال 2013-1985 نوشته شده است که اطلاعات بسیار گرانبهایی را در اختیار پژوهشگران علوم زیستی و ژنتیکی و مولکولی و ... قرار میدهند. این کتابها را میتوان از سایتهای مختلف دانلود و مورد استفاده قرار داد. مثل سایت زیر. اگر نتوانستید برخی از آنها را بیابد ایمیل بزنید تا ارسال نمایم.  http://link.springer.com/bookseries/7651

*همچنین در سایت زیر مخفف یا اختصارات تمامی ژورنالهای آی اس آی دیده می شود. برای دانشجویانی که واسه نوشتن مقالاتشان میخوان، استفاده کنند. http://www.efm.leeds.ac.uk/~mark/ISIabbr

در سایت زیر که موسسه بین المللی اصلاح گندم و ذرت است مقالات و کتابهای زیادی را در خصوص غلات و بخصوص گندم و جو و چاودار و ذرت رایگان دریافت کنید

http://www.cimmyt.org/en/what-we-do/research-publications

از اینجا مستندهای بسیار جذابی از BBC دانلود کنید. هدیه نوروزی به شما.

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۴ بهمن ۱۳۹۱ و ساعت 21:24  

* عزیزانی که بدنبال کتابهای اصلاح نباتات در آزمایشگاه مثل کشت بافت و موضوعات جدید در شرایط درون شیشه (In vitro) و مباحث نوین در اصلاح نباتات هستند میتونن کتاب ما را که جدیداً تجدید چاپ شده را درخواست کنند تا  با احتساب هزینه های خرید و پستی براشون بفرستیم. این کتاب واسه اونایی که میخوان کارشناسی ارشد یا دکتری اصلاح نباتات مولکولی، بیوتکنولوژی گیاهی و بخصوص کشت بافت بخونن بسیار مفیده.این کتاب اولین کتاب ما و همکاران مجربمونه. عکس این کتاب: اینجا

-------------

اخطار!:به اطلاع کاربران و دانش دوستان و خادمان دانش ایران زمین می رسد نقل مطالب وبلاگ ما به هر صورت ممکن بدون اجازه و یا ذکر منبع (وبلاگ ما) ممنوع و قابل پیگیری است!  (بقیه در ادامه مطلب در ذیل)...

قابل توجه دانش آموزان زبان بلد !، دانشجویان، معلمان، اساتید و هنرمندان ریاضیات دوست:

دانلود کتاب جهانی اصول اقلیدس یا اصول هندسة اقلیدس  در ادامه مطلب، Euclid's Elements of Geometry

* نرم افزارهای آمار چندمتغیره Multivariate statistics softwares در Kovach computing services اینجا و اینجا یا اینجا

*نرم افزارهای مولکولی و ژنتیکی و بیوتکنولوژی و ...

1- آیا تابحال برای پایان نامه ها و رساله ها و تحقیقات با مشکل آماری و طرح آزمایشی یا DOE مواجه شده اید؟

- برای مقایسات میانگین عوامل طرح چکار میکنید؟   -برای محاسبه مزیت نسبی یا راندمان نسبی یا برتری نسبی (Relative efficiency) طرح مثلاً بلوک نسبت به کاملاً تصادفی چکار میکنید؟ (هرچند اینجانب در مینی تب برنامه ای را برای مزیت نسبی بلوک نسبت به کاملاً تصادفی و همچنینی مربع لاتین نسبت به کاملا تصادفی و نیر نسبت به بلوک کامل تصادفی در 2 حالت نوشته ایم که فعلا در جایی گزارش نکرده ام و در کتاب مینی تبم اراده میگردد و در اختیار کاربران کتاب قرار میگیرد). برای ...(بقیه در ادامه مطلب).                                                                    

2- بهترین راه انجام تجزیه علیت یا مسیر یا ضرایب مسیر از طریق نرم افزار ما در مینی تب تحتعنوان MULTPATH (دروبلاگ قرار دارد) است. در ادامه جهت ترسیم نمودار تجزیه علیت یا دیاگرام علیت یا Path diagram به کمک نرم افزار جهانی STAT هست که قیمت آن 860 دلار است (ما این نرم افزار را بصورت فول داریم و عادلانه میفروشیم!) است که مثل آب خوردن صورت میگیرد. دیگر نیازی به ترسیم این نمودار با MS Word نیست. در اینجا نمایی از محیط این برنامه و شکلی که ما با آن ترسیم کرده ایم توجه نمایید. ضمناً نمودار حاصله را بصورت PNG ذخیره کنید.  شکل کارهایتان را به ما بسپارید.

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در پنجشنبه ۷ دی ۱۳۹۱ و ساعت 13:4  

معاونت علمی و فناوری ریاست جمهور ی، ستاد توسعه زيست فناوری

http://biodc.ir/c/document_library/get_file?folderId=23203&name=DLFE-403.pdf

1- مقدمه

بیوتكنولوژی (فناوری زیستی) فناوری مولود تلفیق علوم زیستی و دانسته های كشاورزی، پزشكی و فنی مهندسی است و مبتنی بر استفاده از موجودات زنده و یا محصولات (متن PDF این مقاله 35 صفحه ای و مهم را از آدرس فوق بگیرید).

2- کماکان میگم که کتابها و مقالات خوب را از این سایت ها بگیرید:

www.scribd.com

www.docstoc.com

http://www.downloadpaper.ir

http://www.todaydocs.com

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۵ مهر ۱۳۹۱ و ساعت 22:59  

1- احیای یک باکتری 500 میلیون ساله

محققان دانشگاه جورجیا تک موفق شدند در محیط آزمایشگاه یک باکتری را از 500 میلیون سال پیش به این دنیا بازگردانند. {ادامه مطلب در پایین....}

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۷ تیر ۱۳۹۱ و ساعت 1:4  

- همچنین

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۴ آبان ۱۳۹۰ و ساعت 17:58  

 فعالیت های پژوهشی کشاورزی هسته ای در راستای استفاده صلح جویانه از انرژی هسته ای جهت کمک به حل مشکلات کشاورزی کشور با امکانات آزمایشگاهی مجهزو پیشرفته در مرکز تحقیقات کشاورزی و پزشکی هسته ای کرج انجام میشود.

اهداف کلی تحقیقات کشاورزی هسته ای در کشور عبارتند از :

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در پنجشنبه ۷ مهر ۱۳۹۰ و ساعت 23:13  

آگروباکتریوم و کاربرد آن درانتقال ژن  

 آگروباكتريوم: نوعی باكتري خاكزي گرم منفي است كه باعث بيماري گال تاجی در گياهان ميشود.

A.tumefaciens: آگروباكتريوم توم فاسينس- تشكيل گال طوقه

A. rhizogenes: آگروباكتريوم ريزوژنز- بيماري ريشه هاي مويي

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در دوشنبه ۱۳ دی ۱۳۸۹ و ساعت 19:51  

سه مقاله در خصوص مطالب زیر را دانلود کنید. امید که موفق باشید. و در جهت اعتلای ایران اسلامی گام صادقانه بردارید نه مثل برخی از اساتید عزیزی که هدفشان فقط پول است و دیگر هیچ.

مقاله 1

مقاله 2

مقاله 3

http://www.tv7.ir/portal/index.php?option=com_content&id=97&showall=1

برخی از عزیزان به بنده مراجعه و از سایتم تعریف و تمجید می کنند. این لطف و موهبت آنها را نشان می دهد. به هر حال هدف بنده خدمت به خلق اله است و بس. یادم نمی آید آخرین بار کی از وبلاگم باز دید کرده ام. زیرا متأسفانه سیستم نظرخواهی آن از کار افتاده و دوستان قادر به ثبت نظرات سازنده شان نیستند. انشاءالله این مشکل حل شود. در ضمن بی توجه به دید و نظر دوستان نیستم. زیرا e-mail را داده ام و مشمول لطف شان هستم.

برخی نیز طرز وبلاگ سازی را خواسته اند. عرض میکنم اکثریت قریب به اتفاق افراد این کار را به صورت تجاری انجام می دهند. ولی ما در حد وسع فی سبیل اله این خدمت را خواهیم داشت. مدتی است که سرم خیلی شلوغ و به زودی طرز وبلاگ سازی را مبسوط اینجا قرار می دهم.

در ضمن  ما در حد توان جهت انجام آنالیزهای آماری، طرح آزمایشی، آنالیزهای مولکولی مثل تشکیل نقشه های لینکاژی و نقشه یابی QTL با برنامه های مختلف در خدمت دوستان هستیم. البته هزینة این کار قبلاً دریافت میگردد!. تماس moula53@hotmail.com

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در جمعه ۱۸ تیر ۱۳۸۹ و ساعت 2:16  

برای شروع و دستگرمی فعلاً با یک نرم افزار ساده ولی مهم و عجیب که همه ما به آن نیاز داریم ولی از آن اطلاع نداریم شروع میکنم. اسم این برنامه MathType (آخرین نسخه 6.7 است) نام دارد. این برنامه در کنار Microsoft office Word همانند اسیستانت ویندوز به کاربران Word کمک مینماید تا فرمولهایشان را به نحو بهتر و با دست بازتر در برنامه Word بنویسند. زیراکه فرمولهای Word محدود بوده ودر قسمت Equation Editor قرار دارند. این برنامه (ورژن 6 بنام MathType_6_full.rar) را از  اینجا بگیرید و نصب نمایید. سایت سازنده برنامه اینه: http://www.dessci.com/en/products/mathtype که البته به شما ورژن کامل رو نمیده و لی ما میدیم. برای نصب حتماً از برنامه همراه آن یا KeyMaker استفاده کرده و Code لازم را تولید (Generate) و در محل مناسب حین اجرا کپی کرده تا برنامه بصورت Full نصب شود وگرنه جواب نمیدهد. این برنامه تا جایی که بررسی شد معروفترین و کاملترین برنامه های ویرایش معادله است که با اکثر محیطها سازگاری داشته و میتوان فرمولهای تولید شده در آن را به هرجایی مثل وورد یا پاورپوینت و غیره منتقل یا paste نمود. حتماً یادتون باشه که قبل از اتمام و بستن فایل Wordتان آن را در هر دو برنامةWord و Mathtype ذخیره نمایید. که البته از شما در حین بستن فایلها میپرسد.

نرم افزارهای مختلف در اینجا

۱- نرم افزارهاي زيست شناسي مولكولي: http://molbiol-tools.ca/molecular_biology_freeware.htm

۲- نرم افزارهاي ژنتيك: http://www.softgenetics.com/

۳- نرم افزار تجزيه اتوماتيك انگشت نگاري ژل DNA:

http://genome.cshlp.org/content/13/5/940.full

۴- برنامه اي براي وارد كردن اطلاعات ژل به رايانه: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC321066/

۵-نرم افزارهای بیولوژی و ...      http://en.bio-soft.net

نیز    بسیار عالی      http://molbiol-tools.ca/molecular_biology_freeware.htm

6- نرم افزارهای ژنتیکی و مولکولی و زیست شناسی زیست فنآوری و ...:     http://linkage.rockefeller.edu/soft 

7- نرم افزارهای ژنتیک آماری یا  Statistical genetics در : http://linkage.rockefeller.edu 

8- نرم افزارها - برنامه های فیلوژنی و مولکولی - تکامل و ... در اینجا  و   اینجا

..........................................................................................................

WhiteSmoke  نرم افزاری برای تصحیح املاء و نگارش مقالات و متون انگلیسی

 امروز نرم افزاری را براتون معرفی می کنم که WhiteSmoke نام داره و با اون به راحتی مقالات انگلیسیتون را بدون کمک گرفتن از هر معلم زبان و یا هر مؤسسه خارجی تصحیح کرده و برای ژورنال خارجی می نویسید.

الحقیرالمسکین المستکین معتقدم که شخص محقق می تونه کاراشو خودش تا جایی که ممکنه انجام بده و وجه کمتری خرج کنه.

همونطور که می دونید، برای نگارش مقالات انگلیسی یا متون خارجی، مشکل اصلی ما ایرانیا زبان انگلیسیه که در کشور تازه متوجه شدن که زبان خارجی لازمه و اساس پیشرفت و عقب نموندن از دنیا.

به هرحال، بعد از نوشتن مقالات انگلیسی، مشکل نگارش و تصحیحات املایی و نحوی آن باقی می ماند که مردم چند تا راه رو برای حل این معضل در پیش می گیرند که از این قرارند:

1- تصحیح خود نویسنده که اگه زیاد وارد به انگلیسی نباشه معمولاً مقاله واسه چاپ شدن در مجلات خارجی بخصوص با IF بالا به مشکل بر میخوره.

2- تصحیح مقاله های علمی توسط مدرسان زبان انگلیسی که البته از نظر نگارشی خوبه ولی چون اصطلاحات تخصصی را بلد نیستند باز هم توصیه نمی شود.

 سه روش دیگه میمونه که بنده اونا رو توصیه می کنم.

3- اولیش تماس و همکاری با یک نویسنده و شخص خارجی الاصل به عنوان همکار و زحمت مقاله لاتین را به گردن اون انداختن که اگه بگیره عالیه.

4- اگه این روش جواب نداد استفاده از مؤسسات خارجی مرتبط با ژورنالهای معتبر مثل  languageediting.elsevier.com  که راه بسیار خوب و بهترین روشه ولی یه عیب بزرگ داره و اون مشکل مانیه ! (Money). که ما ایرانیا تو این قضیه دوس داریم قصر در بریم و کمتر کسیه که برای تصحیح و نگارش مقالاتش پول خرج کنه.

5- روش دیگه ای می مونه که راحت تره و البته به پای مؤسساتی مثل سرویس های  elsevier language editing نمی رسه ولی برای من و شما فقرا خوبه و شاید the best.

الف- برای این کار نرم افزار را  از   اینجا    دانلود کنید.

برای کار کردن با این برنامه باید به اینترنت وصل باشید.

نرم افزار را باز کرده و متن تان را داخل آن paste کرده و گزینه check را بزنید تا متن از نطر املا و نگارش چک شده و غلط ها را نمایش دهد.

حالا برای تصحیح اتومات گزینه ای به نام Autocorrect را بزنید که در سلول مربوط به check و بالای آن است. تا متن به طور خودکار تصحیح گردد.

حالا متن تان که تصحیح کردید کلمات و اصطلاحات سبز را به جای غلط ها وارد نموده و گزینه Apply را زده تا ذخیره گردد.

برای خروج از برنامه در گوشه سمت راست در پایین دسکتاپ روی منوی برنامه راست کلیک کرده و اونو Shutdown کنید.

راستی یادم رفت بگم. اسم این برنامه اینه: WhiteSmoke

و رمز باز کردن فایل بعد از دانلود هم اینه: melmel

حالا یک کار دیگه مونده و اون اینه:    Enjoy !.

----------------------------------------------------------

تصحیح و ویرایش متون انگلیسی مثل مقاله های لاتین با نرم افزار ویرایش متون

http://www.editorsoftware.com/DownloadSW4.html

Stylewriter 4 download INSTRUCTIONS

1. Click here to download StyleWriter 4.

2. Save the download file: StWrIV-3setup.exe to the desktop.

3. To install this copy of StyleWriter 4 right-click StWrIV-3setup.exe and select ‘Run as Administrator’

Using StyleWriter
Once installed, you should have the StyleWriter icons in Word's toolbar or in later editions in the Add-Ins tab.

You run StyleWriter by:

1. Opening or creating and saving a file in Word.

2. Click on the StyleWriter icon.
   StyleWriter opens and checks the file showing you where and how to edit.
   You edit by clicking on the blue-underlined alternative (changes in both StyleWriter and Word) or using the Edit/Resume button to move between Word and StyleWriter to make your changes manually.

3. When you have finished editing, close StyleWriter and save your Word file.

We recommend you look at the Tutor (see StyleWriter's icons above) as it explains the program's key features.

The 14-day time limit

------------------------------------------------------------------------------------

- چگونگی باز نمودن فایلهای ساخته شده توسط آفیس 2007 (Word , Excel , Powerpoint) در آفیس 2003 (Word, Excel, Powerpoint) بدون نصب آفیس سنگین 2007:

- آیا شده تا بحال بر روی کامپیوتری که فقط آفیس 2003 نصب است بخواهید فایلی از آفیس 2007 بخصوص Word 2007 با پسوند docx.* را باز کنید ولی نتوانید. تقصیر از آدمینسترتاتور است که آفیس 2003 را نصب نکرده ولی به او بدو بیراه نگویید. با برنامه ای که در اختیارتان می گذارم بدون نصب برنامه های آفیس 2007 می توانید این کار را بکنید. برای این کار برنامة Word-Excel-Powerpoint-Converters-good.exe‌ را از اینجا دانلود کرده و اجرا یا نصب نمایید. توجه کنید که بعد از نصب هیچ آیکونی بر روی رایانه تان مشاهده و ایجاد نمی شود. فقط بعد از نصب کافی است که فایلتان را دبل کلیک کنید تا باز شود. OK??

-----------------------------------------------------------------------------------------

نرم افزاری برای تشکیل و ساختن فونت های دلخواه مثل فونت نوشتاری در Word

آیا تاکنون به فکر افتاده یا نیاز پیدا کرده اید که فونت های دلخواه خود را به دلخواه بسازید. مثلا از حرف "ی" در فونت Andalus  خوشتان نمی آید و میخواهید کمی قسمت انتها یا وسط این حرف را تغییر دهید. ولی نمی توانید. ما به شما می گوییم که این کار را چگونه انجام دهید. این کار را با نرم افزار 

انجام دهید. طرز کاربسیار سهل است. برنامه را از سایت www.4shared.com گرفته و نصب کرده و از قسمت Open رفته و Installed fonts را انتخاب و فونتتان را مثلا Andalus را باز کرده و سپس مثلا روی حرف "ی" دوبار کلیک تا بزرگ شده و سپس مجددا روی آن حرف دوبار کلیک کرده تا مربعهای ریز و کوچکی تمامی محیط حرف را احاطه کنند و دورتادور حرف را یا به اصطلاح حاشیه اش را مشخص کنند. سپس هر قسمت را که میخواهید با ماوس گرفته و به چپ یا راست یا بالا و پایین کشیده تا تغییر کرده و سپس ذخیره کنید.  من اله توفیق.  

-----------------------------------------------------------------------------------------------

سه نرم افزار ارزشمند برای کاربران سایتم:

نرم افزار آیین نامه راهنمایی و رانندگی

نرم افزار کتاب زبان 504

نرم افزار آنتی ویروس فلش مموری

از اینجا و اینجا و اینجا  دانلود کنید

نرم افزار قدرتمند ریزماهوارک (توالی های تکراری ساده یا SSR)

با نرم افزاری که در اینجا واستون گذاشتم براحتی میتونید تجزیه و تحلیل های مربوط به نشانگر ریزماهوارک را از قبیل محاسبه فراوانی آلل ها و تجزیه واریانس مولکولی یا آمووا (AMOVA) را براحتی انجام داده و پارامترهای زیادی را بدست آورید. برای نصب نرم افزار ابتدا در نرم افزار 2003 Excel وارد Tools > Macros > Security شده و آن را روی Medium و Enable Macros قرار داده و سپس داده ها را در اکسل با SSR تجزیه و تحلیل کنید در مسیر: Tools > Microsatellite > Microsatellit toolkit

از اینجا دانلود کنید

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در پنجشنبه ۵ آذر ۱۳۸۸ و ساعت 1:10  

در زير سايتي را مشاهده مي كنيد كه توسط آن مي توانيد پروتكلهاي فراواني را درخصوص بيوتكنولوژي پيدا كنيد. اينها بسيار مفيد هستند.

به عنوان مثال بعضي از اينها شامل موارد زيرند:

استخراج DNA  از سلولهاي گياهي

استخراج RNA  از سلولهاي گياهي

الكتروفورز ژل الكتروفورز

بافرها و محلولهاي استاندارد

الكتروفورز پروتئين

واكنش زنجيره اي پليمراز PCR

نورثرن بلات ، ساترن بلات و وسترن بلات و دهها پروتكل ديگر.

http://ivaan.com/protocols

--------------------------------------------------------------------------------------------------

E-mail:karim_sorkheh2000@yahoo.com

چكيده
انتقال ژن يا جذب DNA فرايندي است كه قطعه مشخصي از DNA ( معمولاً يك ژن خارجي وارد شده در پلاسميد باكتريايي) را به درون سلول¬ها وارد مي¬نمايد. در اصلاح نباتات، تكنيك¬هاي مرتبط با انتقال ژن از طريق تكثير جنسي و رويشي به خوبي رايج مي¬باشند. هدف از اين تكنيك¬ها ايجاد تنوع ژنتيكي در جوامع گياهي، انتخاب گياهان برتر از نظر ژنهاي كنترل كننده صفات مطلوب و همچنين حفظ تنوع واريته¬هاي گياهي مي¬باشد. با استفاده از تكنيك¬هاي اصلاحي مرسوم، پيشرفت¬هاي چشم¬گيري در زمينه بهبود عملكرد گياهان زراعي حاصل شده است. معذالك اين تكنيك¬ها وقت¬گير هستند. در سالهاي اخير، بيوتكنولوژي گياهي منبعي سرشار از ابداع و خلاقيت بوده است و براي رفع مشكلات قديمي راه حل¬هاي نويني فراهم كرده است. بنابراين، در اين مقاله سعي شده است كه چشم¬انداز حال و آينده انتقال ژن را در بهبود گياهان زراعي مورد بررسي قرار دهد.

واژه¬هاي كليدي: انتقال ژن، گياهان زراعي، DNA

دهها سال است كه انتقال ژن بين گونه¬هاي گياهي نقش مهمي در بهبود گياهان زراعي بازي كرده است. بهبود گياه چه در نتيجه انتخاب طبيعي و يا با تلاش¬هاي به¬نژادگران، هميشه بر اساس ظهور، ارزشيابي و گزينش تركيبات صحيح آلل¬ها بوده است. صفات مفيد از قبيل مقاومت به بيماري¬ها، حشرات و آفات از گياهان غير زراعي به واريته¬هاي گياهان زراعي منتقل شده است. از سال 1970، پيشرفت قابل ملاحظه¬اي در ابداع ابزارهاي لازم براي دستورزي اطلاعات

به ادامه مطلب بروید ...

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در شنبه ۵ مرداد ۱۳۸۷ و ساعت 21:32  

دو مقاله بسيار معروف و پركاربرد در زمينه استخراج DNA گياهان:    :Plant DNA extraction   

M.G.Murray and W.F.Thompson. 1980. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA

Saghai-Maroof et al., 1984. Ribosomal DNA

مقاله اول به روش تامسون و مراي-۱۹۸۰ معروف است.

مقاله دوم نيز به روش سقايي- معروف و همكاران - ۱۹۸۴ معروف است.

****************************************

معرفی يک روش جديد، ساده و سريع استخراج DNA از بافت گياهی

A simple and fast novel method of plant DNA extraction

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۱۱ دی ۱۳۸۶ و ساعت 16:58  

Ph.D dissertations

رساله هاي دكتراي تخصصي ( Ph.D dissertations ) را همه قبول دارند و مقاله هاي مستخرج از آنان را سريع چاپ ميكنند، زيرا محقق آنها زمان كافي براي تعميق موضوع را داشته است. ابتدا بهتر است با شيوه نگارش رساله هاي دكتري آشنا شويم. براي اين به دو سايت زير مراجعه نماييد:

http://members.verizon.net/~vze3fs8i/air/airphd.html   how to write a Ph.D thesis
http://writing-services.org/blog/2007/10/29/phd-dissertation-writing/

و اكنون در سايت هاي زير ميتوانيد بسياري از رساله هاي دكتراي تخصصي (در قالب PDF) يافته و از آنها لذت ببريد:

http://www2.acs.ncsu.edu/grad/ETD

http://rudar.ruc.dk/handle/1800/2404

http://library.stanford.edu/africa/theses.html

http://www.nscl.msu.edu/ourlab/publications/year

http://www.csg.ethz.ch/research/dissertation_prj

http://edt.missouri.edu/browse.php?meth=1

http://eprints.hec.gov.pk/view/year

http://ethesis.helsinki.fi

http://etd.lsu.edu

http://adt.caul.edu.au

http://library.wur.nl/wda

http://eprints.usq.edu.au/view/for08

http://bpt.hec.gov.pk/view/subjects

http://thesis.library.adelaide.edu.au

http://www.kp.ipw.agrl.ethz.ch/docs/PhD_theses

http://www.kp.ethz.ch/docs/PhD_theses

*****************************************

برای گرفتن سمینارها و اسلایدهای ژنتیک و اصلاح نباتات و زراعت به این آدرس مراجعه کنید

http://www.agron.iastate.edu/news/podcasts/Default.aspx

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۴ مهر ۱۳۸۶ و ساعت 16:0  

 واژه نامه ها، مقالات ، معرفی کتب و سایتهای مرتبط:

 ژنتیک- بیوتکنولوژی، - ژن - کروموزوم - ژن درمانی - DNA - سلولهای بنیادی -   

منبع: اطلاعات ژنتیک - Genetics informations

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:4  

مقدمه

۱-  دوره اول: در این دوره انسان بدون شناخت نظام تولید مثل گیاهان ، برای اولین بار به کشت و تولید مصنوعی گیاهان تحت شرایط کنترل شده اقدام نمود. در این دوره انسان ، گیاهان برتر و مطلوب را ذخیره و نگهداری می‌کرد و به این ترتیب عمل انتخاب ناخود آگاه صورت گرفت. با مرور زمان اهلی کردن حیونات نیز آغاز شد بنابراین کشت گیاهان همراه با اهلی نمودن دامها انجام شد.

۲-  دوره دوم: در این دوره انسان به نظام تولید مثل گیاهان پی برد و به آمیزش گونه‌های مختلف گیاهان پرداخت. اما هنوز اصول علمی ژنتیک کشف نشده بود و تلاقی گونه‌ها بطور تصادفی و به عنوان یک نوع هنر صورت می‌گرفت.... 

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:3  

استفاده از روشهاي كلاسيك و نوين اصلاح نباتات

 در بهبود عملكرد

Using classical and modern plant breeding approches for yield improvement

بيوک رئيسي
پژوهشکده بيوتکنولوژي کشاورزي شمالغرب و غرب کشور

منبع: http://www.parsbiology.com/discuss/article.aspx?AID=58&TID=10


اصلاح نباتات :
اهلي نمودن گياهان يكي از مهمترين وقايع كشاورزي در دنياي جديد است. هدفهاي كلي اصلاح نباتات افزايش عملكرد در واحد سطح بهتر نمودن كيفيت محصولات كشاورزي و توليد مواد اوليه مورد نياز جوامع انساني است. ارقام و واريته‌هاي اصلاح شده گياهان زراعي و زينتي هر ساله از كشوري به كشور ديگر انتقال داده مي‌شود. بدين طريق كيفيت و كميت محصولات كشاورزي افزايش يافته و احتياجات فراورده‌هاي زراعي رفع مي‌شود. در اغلب گياهان يك يا چند ژن باارزش اقتصادي فراوان دارد. ژنهايي كه حساسيت و مقاومت گياهان را نسبت به امراض و آفات كنترل مي‌كنند در اولويت برنامه‌هاي اصلاح نباتات قرار دارند. هدف اصلاحگر نبات نبايد در توسعه روشهاي معمول كشت نباتات اصلاحي منحصر گردد بلكه بايستي همواره در جستجوي تركيبات نو از ژنوتيپهاي مطلوب باشد.
هدف اصلاحي نهايي در هر برنامه اصلاحي افزايش عملكرد مي‌باشد. در شرايط نا مساعد افزايش عملكرد به طريق اصلاح نباتات به مقدار كم و صرف زمان طولاني ممكن است ژنهاي كنترل كننده عملكرد براي بروز حداكثر پتانسيل خود به عوامل محيطي توليد وابسته مي‌باشند. به طور كلي عمدترين اهداف اصلاح نباتات را مي‌توان در عناوين زير خلاصه مي‌شود.
۱- بهبود كيفيت
كيفيت خصوصيتي است كه باعث افزايش ارزش محصول مي‌شود كيفيت در جائي ممكن است به ارزش غذايي يك غله يا طعم و بافت يك ميوه تلقي شود. كيفيت جزء مهمي از هر برنامه اصلاح نباتات محسوب مي‌شود. به عنوان مثال ژنوتيپهاي مختلف گندم آرد توليدي حاصل از آن را تحت تاثير قرار داده و نهايتاً حجم و بافت و رنگ نان را مستقيماً تحت تاثير قرار مي‌دهد. بهرحال در گياه اصلاح شده از لحاظ پروتئين و اسيدهاي آمينه ممكن است متفاوت باشد. در اهداف توليد نباتات علوفه‌اي توجه به كيفيت علوفه همواره مسئله خوش‌خوراكي و ارزش تغذيه‌اي را در بردارد در گياهان زينتي كيفيت مفهومي جدا از گياهان زراعي دارد. خصوصيات كيفي در گلهاي زينتي عمدتاً همچون شكل ظاهر، شدت و ميزان عطر ساطع شده و وجود و عدم وجود تيغ، تعداد گلبرگ را شامل مي شود. در ميوه ها و محصولات انباري كه طيف وسيعي از ميوه جات و سبزيجات را در بر مي گيرد كيفيت معمولاًَ به مقاوم و ماندگاري خصوصيات بيوشيميايي محصول انبار شده در برابر تغييرات طولاني مدت محيط فيزيكي را شامل مي شود. خصوصيات انباري از مهمترين شاخصهاي اقتصادي را شامل مي شودكه با بازار پسندي محصول ارتباط مستقيمي دارد.
۲- افزايش توليد در واحد سطح:
                                            ادامه در صفحه بعد:

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:2  

به نقل از: محمدمير، ۶/۶/۱۳۸۱:   http://bio.itan.ir/?ID=220

ابعاد اقتصادي بيوتكنولوژي در حوزه كشاورزي

حوزه­هاي مختلف بيوتكنولوژي گياهي نوين

الف) مهندسي ژنتيك و دي‌ان‌آي نوتركيب

گياهان تراريخته و اهميت اقتصادي آن‌ها

مثالهايي از كاهش خسارات آفات

زمينه­هاي مختلف كاربرد گياهان تراريخته

ب) كاربرد نشانگرهاي مولكولي

ج) كشت سلول‌ها و بافت‌هاي گياهي

برخي كاربردهاي كشت بافت گياهي

مقدمه
بر اساس گزارشات سازمان ملل، حدود 800 ميليون نفر از جمعيت جهان (14 درصد) دچار فقر غذايي هستند كه تا سال 2020 به يك ميليارد نفر خواهند رسيد. تخريب روزافزون جنگل‏ها، مراتع و فضاي سبز، گسترش بيابان‏ها، نابودي گونه‏هاي متنوع گياهي و جانوري، مقاوم شدن آفات و عوامل بيماري‏زا به سموم و بروز بسياري مسائل جدي ديگر هر روز ابعاد گسترده‏تري مي‏يابد.

.............

به ادامه مطلب برويد...

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:1  

كاربردهاي بيوتكنولوژي در ژنتيك و اصلاح دام

آرش جوانمرد
فارغ التحصیل کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دانشگاه تهران

منبع: http://www.parsbiology.com/discuss/article.aspx?AID=56&TID=4
 

بيوتكنولوژي يا فنآوري زيستي، كه به صورت توانائي بكارگيري فرآيندهاي زيستي در بعد صنعتي تعريف ميشود در دو دههِ گذشته، كاربردهاي گستردهاي در عرصه هاي كشاورزي وبهداشت، محيط زيست و غيره يافته است.بيوتكنولوژي در مفهوم عام و نزد اكثريت مردم معناي درآمد بي دردسر را تداعي نموده است و در دههِ اخير اين كلمه را غالبا به مفهوم همه چيز براي همهِ مردم كار مي برند.تاريخچه بيوتكنولوژي نشان مي هد كه سابقه استفاده از آن به 8 هزار سال قبل مي رسد. درزمان سومريان و روميها از ميكروارگانيزمها استفاده ميكردند. حتي در جنگ جهاني نيز آلمانها كه ازواردات گليسرول براي تهيه مادهِ منفجره نااميد شده بودند از راه توليد ميكروبي از مخمر به گليسرول رسيدند
‌‌ از دهه1980، بيوتكنولوژي زمينهِ جديدي را براي رشد پيدا نمود كه‌اين تغيير مرهون پيشرفتي است كه حاصل فن‌آوري برش و اتصال مولكولDNA به صورت دلخواه ميباشد. اكنون اين تفكر كه بيوتكنولوژي با تكيه بر دستاوردهاي مهندسي ژنتيك قادر است منافع عظيمي را نصيب بشريت نمايند، به شدت تقويت يافته است.مهندسي ژنتيك در واقع انقلاب عظيمي را در علوم زيستي به وجود آورده‌و با سابقهِ كوتاه قريب بيست سال، سرشار از نتايج مثبت است. تحليلگران آگاه قرن آينده را قرن امپراطوري مهندسي ژنتيك، كامپيوتر و ليزر ناميده‌اند. امروزه در اثر مطالعات عميق و بررسيهاي ژرف مرزهاي ژنتيك مولكولي و يافته هاي‌ مربوطه شناخت ژنها به گونه‌اي دور از تصور گسترش يافته و حجم اط‌اعات حاصله و رشد روزافزون آن قابل مقايسه با هيچ دوراني نمي باشد. نمودار زير به بعضي ازتوانمنديهاي بيوتكنولوژي در علوم مختلف اشاره مي كند:

ژن‌ درماني‌
‌‌‌‌ژن‌ درماني‌ اصلاح‌ يك‌ اشتباه‌ متابوليسمي‌ مادرزادي‌ با وارد كردن‌ يك‌ ژن‌ طبيعي‌ در فرد مبتلامي‌باشد. البته‌ در مورد جانوران‌ اشتياق‌ زيادي‌ براي‌ زنده‌ نگاه‌ داشتن‌ مبتلايان‌ به‌ بيماريهاي‌ شديد وسخت‌ ژنتيكي‌ وجود ندارد.‌‌‌‌اخيراإ روش‌ انتقال‌ ژنها در داخل‌ سلول‌ نطفه‌اي‌ موش‌ به‌ منظور رفع‌ يك‌ نقص‌ ژنتيكي‌ موردتجربه‌ قرار گرفته‌ است. در اين‌ تجربه‌ ملكولهايDNA ‌را كه‌ شامل‌ رديف‌ كددار براي‌ سنتز پروتئين‌آزاد كنندهِ گونادوتروپين(Ghrh)هستند، بداخل‌ هسته‌ تخمك‌ بارور موشهائي‌ كه‌ مبتلا به‌ كم‌كاري‌ موروثي‌ غدد جنسي‌ بودند تزريق‌ نمودند. ژن‌ تزريق‌ شده‌ در هيپوتالاموس‌ تعدادي‌ از موشهاي‌توليد شده، فعال‌ گرديد و رمز خود را در راه‌ سنتز هورمون‌ نامبرده‌ بيان‌ داشت. بعلاوه‌ فعاليت‌ ژن‌بطور طبيعي‌ تحت‌ اثر سيستم‌ تنظيم‌ كننده‌ قرار گرفته‌ و حيوان‌ از هر لحاظ‌ طبيعي‌ بوده‌ است. از اين‌گذشته‌ در نسلهاي‌ بعدي‌ حيوان‌ نيز اثري‌ دال‌ بر كمبودGhrh مشاهده‌ نشده‌ است‌.

 انتخاب‌ براساس‌ نشانگرها
‌‌‌‌متخصصان‌ اصلاح‌ نژاد ...

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:0  

نشانگرهای مولکولی در اصلاح نباتات 

مثل RAPD , AFLP , SSR

Molecular Markers in Plant Breeding 

  http://library.wur.nl/wda/dissertations/dis2769.pdf 

 :And

http://upetd.up.ac.za/thesis/available/etd-02212006-112610/unrestricted/00front.pdf                       

http://www.plantbiotechno.blogfa.com/

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 15:0  

بروز شده در ۸/۱۱/۸۶

لطفاً روی سايتهاي زير کليک کنيد:

توابع نقشه يابي (هالدين و كوزامبي):

http://www.ndsu.edu/ndsu/abergstr/webcourses/genetics/mf/mf02.htm

http://www.stat.wisc.edu/~yandell/statgen/reference/qtl.html

براي گرفتن نرم افزار هاي مربوطه به سايتهاي زير برويد:

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software

http://www.broad.mit.edu/ftp/distribution/software

:Softwares for Molecular Markers & QTL Analyses

http://www.eadgene.info/ToolsResources/RepositoryofAnalyticalTools/SoftwareforMolecularMarkersQTLAnalyses/tabid/333/Default.aspx

http://www.stat.wisc.edu/~yandell/statgen/software/biosci/linkage.html#linkage  

  Statistical Genetics: Gene Mapping Through Linkage and Association  

*************************** 

چند مقاله فارسي در زمينه نقشه يابي QTL :

لازم به ذكر است كه اين مقاله ها در مجله علوم كشاورزي ايران-كرج چاپ شده و بصورت آنلاين و مجاني قابل دسترسي اند.

۱- نقشه يابي QTL ها در گندم            QTL mapping of wheat (Triticum aestivum 

     http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi1.zip

۲ - نقشه يابي QTL ها در گندم           QTL mapping of wheat (Triticum aestivum

http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi2.zip

۳- ترسيم نقشه ژنتيكي جو با AFLP mapping of Barley using AFLP (Hordeum vulgare     AFLP

http://abeyran.googlepages.com/BarleymappingviaAFLP-farsi.zip

4- نقشه يابي QTL هاي روغن در كلزا    QTL mapping of Canola oil (Brassica napus

http://abeyran.googlepages.com/QTLcanola-farsi.zip

۵- آناليز ژنتيکي و تعيين نقشه مولکولي QTL هاي مرتبط با مقاومت به خشکي در ذرت

انستيتو تحقيقات کشاورزي هند (پوسا) ـ دهلي

هدف از مطالعه فوق را مي توان در سه بخش خلاصه كرد:

الف) آناليز تنوع ژنتيکي در ژرم پلاسم ذرت براي مقاومت به خشکي و تشخيص لاين ها و هيبريد هاي مقاوم به خشکي.

ب) مطالعه پلي مورفيسم در لاين هاي مقاوم و حساس انتخابي.

ج) تعيين نقشه QTL هاي صفات مختلف مرتبط با خشکي.

آزمايش با استفاده از 76 اينبرد لاين مختلف در دو آزمايش جداگانه در سالهاي زراعي 2002-2001 و 2004-2003 در شهر حيدرآباد انجام گرفت و 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي در شرايط استرس خشکي و نرمال اندازه گيري گرديد. مطالعه فوق نشان داد که بسياري از لاين هاي مکزيکي و هندي در زمان گلدهي شديدا تحت تاثير خشکي واقع مي شوند. در مجموع 3 لاين از کشور هند IPA29B، FSA17 و CM140 و 10 لاين از سيميت به شرايط خشکي در زمان گلدهي مقاومت بسيار بالايي را نشان دادند. مطالعه پلي مورفيسم با استفاده از 12 لاين مختلف با واکنشهاي متفاوت به خشکي انجام گرفت. از مجموع 110 مارکر SSR، 71 مارکر  پلي مورفيسم نشان دادند. در تحقيق فوق مجموعا 331 الل SSR و به طور متوسط 69/4 الل در هر لوکوس مشخص گرديد. در آناليزهاي Clustering،Bootstrap و Principal component، تعداد 4 کلاستر عمده تشخيص داده شد که به طور وضوح لاينهاي مقاوم به خشکي تامين شده توسط سيميت از بقيه لاين ها متمايز بودند.

براي تعيين نقشه QTL هاي مرتبط با صفات متاثر از خشکي در ذرت از لاين هاي نوترکيب Recombinant Inbred Line (RIL) استفاده شد. جمعيت فوق شامل 210 RIL Families  است که از تلاقي دو لاين مقاوم (Ac7643) و حساس (Ac7729) به خشکي توليد شده اند. 210 لاين نو ترکيب فوق در قالب طرح آلفا لاتيس و در دو شهر کريم نگر(2003-2002) و حيدرآباد(2004-2003) و در فصل زمستان (فصل خشک) کشت و بعد از استرس خشکي، 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي يادداشت برداري شد. آناليز داده هاي فوق با استفاده از مدل Composite Interval Mapping  منجر به تعيين 52QTL براي صفات مختلف در آزمايش کريم نگر (شامل 22 QTL  در شرايط نرمال و 30 QTL در   شرايط خشکي) و 14QTL  در شرايط استرس خشکي در آزمايش   حيدرآباد گرديد.

مقايسه نتايج حاصل از داده هاي حيدرآباد و کريم نگر وجود QTL هايي روي کروموزومهاي شماره 1، 2، 8 و 10 را مشخص نمود، که در شرايط استرس خشکي در هر دو ناحيه حيدرآباد و کريم نگر صفات بخصوصي را تحت تاثير قرار مي دهند. نتايج مشابه حاصل از مطالعه فوق با نتايج حاصل از مطالعات سيميت در مکزيک و کنيا روي لاين هاي نوترکيب يکسان QTL هاي عمومي را مکشوف مي سازد که ارزش بسيار بالايي در اصلاح ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي دارند. مطالعه فوق براي اولين بار در هند انجام مي گيرد و مي تواند نقش بسزايي در انتخاب، اصلاح و بهبود ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي و روش  Marker Assisted Breeding  به ارمغان آورد.

به نقل از http://sinaps-s.blogfa.com/86034.aspx

------------------------------------------------------------------

نرم افزارهای مورد استفاده در تهیه نقشه های ژنتیکی

نرم افزارهای مورد استفاده در تهیه نقشه های ژنتیکی

نرم افزارهای مختلفی برای ترسیم نقشه های ژنی وجود دارد. اما تفاوت اساسی آنها در الگوریتم های به کار رفته برای مرتب کردن نشانگرها و نوع جمعیتی که استفاده شده است؛ می باشد. در ترسیم نقشه جمعیت های کوچک و فامیل های نسبتاً دور (مانند انسان و اصلاح دام) اطلاعات مربوط به 2 یا 3 نسل متوالی مورد استفاده قرار می گیرد و از نرم افزارهای لینکاژ (Linkage) یا کری مپ (Crimap) استفاده می شود. نرم افزار مپ میکر (Mapmaker) غالباً در جمعیت های .... (به ادامه مطلب بروید):

به نقل از علیرضا سیدمحمدی و تشکر از ایشان در سایت: http://alireza1979.blogfa.com/post-25.aspx

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 14:0  

 Bioinformatics‌‌‌

انجمن بیوانفورماتیک ایران

 به نقل از سایت:

http://fa.wikipedia.org/wiki/%D8%A8%DB%8C%D9%88%D8%A7%D9%86%D9%81%D9%88%D8%B1%D9%85%D8%A7%D8%AA%DB%8C%DA%A9

بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از کامپیوتر، نرم‌افزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی می‌گردد تا به مسائل بیولوژیکی بخصوص در زمینه‌های سلولی و ملکولی پاسخ داده شود. در این علم با بکارگیری کامپیوتر سعی می‌گردد تا تحقیقات وسیعتری در خصوص پروتئین‌ها و ژنها بعمل آید.

دو فعالیت برجسته‌ای که بیوانفورماتیک دانان به آن مشغول هستند پروتئومیک و ژنومیک می‌باشد.

ژنومیک شامل ...

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 13:28  

 پروتئوميكس -  Proteomics

     براي آشنايي با پروتئوميكس به آدرسهاي زير مراجعه كنيد:

http://www.iupac.org/publications/pac/2004/pdf/7604x0829.pdf

http://bfgp.oxfordjournals.org

http://www.oardc.ohio-state.edu/tomato/Proteomics%20Presentation.pdf

http://cmbi.bjmu.edu.cn/2d/show2d/slide/Proteomics.pdf

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 13:26  

   دکتر مصطفی رونقی

.....  علمی است در مورد ژنوم، درباره اين که ژنها چگونه بر يکديگر اثر می گذارند. ژنوم از .....

 منبع:        http://biotech.schoolnet.ir/resources

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 13:0  

 :به منابع زير مراجعه شود (Automated DNA Sequencing) براي توالي يابي اتوماتيك  

1- http://www.nucleics.com/DNA_sequencing_tools/DNA_sequencing_tools.html

2- http://www.elsevier.com/wps/find/products_in_subject_and_group.cws_home/678819

3- http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/254/5028/59

4- http://www.ibt.lt/sc/files/DNASeqCG.pdf

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در شنبه ۱۹ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 21:13