198 جلد کتاب و مخففات و ...

* برای دانلود مقالات قدیم و جدید بصورت مجانی از ژورنالهای مهم و تامسون رویترز همانند کروپ ساینس و اگرونومی و ... به رمز عبور و پسورد نیاز دارید. شرکتها و افراد مختلفی این کار را پولکی با اخذ هزینه ی گزاف میکنند. ولی ما مجانی. ما که نه. در حقیقت سایت خوبم http://economicsphd.ir/f4 با ثبت نام.

* تعداد 198 جلد کتاب از مجموعه ی عظیم Methods in molecualr Biology از سال 2013-1985 نوشته شده است که اطلاعات بسیار گرانبهایی را در اختیار پژوهشگران علوم زیستی و ژنتیکی و مولکولی و ... قرار میدهند. این کتابها را میتوان از سایتهای مختلف دانلود و مورد استفاده قرار داد. مثل سایت زیر. اگر نتوانستید برخی از آنها را بیابد ایمیل بزنید تا ارسال نمایم.  http://link.springer.com/bookseries/7651

*همچنین در سایت زیر مخفف یا اختصارات تمامی ژورنالهای آی اس آی دیده می شود. برای دانشجویانی که واسه نوشتن مقالاتشان میخوان، استفاده کنند. http://www.efm.leeds.ac.uk/~mark/ISIabbr

در سایت زیر که موسسه بین المللی اصلاح گندم و ذرت است مقالات و کتابهای زیادی را در خصوص غلات و بخصوص گندم و جو و چاودار و ذرت رایگان دریافت کنید

http://www.cimmyt.org/en/what-we-do/research-publications

از اینجا مستندهای بسیار جذابی از BBC دانلود کنید. هدیه نوروزی به شما.

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۴ بهمن ۱۳۹۱ و ساعت 21:24  
 نقل مطالب وبلاگم بدون اجازه، نرم افزارهای جدید آمار و طرح، بیومتری ...
سلام دوستان

 

* عزیزانی که بدنبال کتابهای اصلاح نباتات در آزمایشگاه مثل کشت بافت و موضوعات جدید در شرایط درون شیشه (In vitro) و مباحث نوین در اصلاح نباتات هستند میتونن کتاب ما را که جدیداً تجدید چاپ شده را درخواست کنند تا  با احتساب هزینه های خرید و پستی براشون بفرستیم. این کتاب واسه اونایی که میخوان کارشناسی ارشد یا دکتری اصلاح نباتات مولکولی، بیوتکنولوژی گیاهی و بخصوص کشت بافت بخونن بسیار مفیده.این کتاب اولین کتاب ما و همکاران مجربمونه. عکس این کتاب: اینجا

-------------

اخطار!:به اطلاع کاربران و دانش دوستان و خادمان دانش ایران زمین می رسد نقل مطالب وبلاگ ما به هر صورت ممکن بدون اجازه و یا ذکر منبع (وبلاگ ما) ممنوع و قابل پیگیری است!  (بقیه در ادامه مطلب در ذیل)...

 

قابل توجه دانش آموزان زبان بلد !، دانشجویان، معلمان، اساتید و هنرمندان ریاضیات دوست:

دانلود کتاب جهانی اصول اقلیدس یا اصول هندسة اقلیدس  در ادامه مطلب، Euclid's Elements of Geometry

* نرم افزارهای آمار چندمتغیره Multivariate statistics softwares در Kovach computing services اینجا و اینجا یا اینجا

*نرم افزارهای مولکولی و ژنتیکی و بیوتکنولوژی و ...

 

1- آیا تابحال برای پایان نامه ها و رساله ها و تحقیقات با مشکل آماری و طرح آزمایشی یا DOE مواجه شده اید؟

- برای مقایسات میانگین عوامل طرح چکار میکنید؟   -برای محاسبه مزیت نسبی یا راندمان نسبی یا برتری نسبی (Relative efficiency) طرح مثلاً بلوک نسبت به کاملاً تصادفی چکار میکنید؟ (هرچند اینجانب در مینی تب برنامه ای را برای مزیت نسبی بلوک نسبت به کاملاً تصادفی و همچنینی مربع لاتین نسبت به کاملا تصادفی و نیر نسبت به بلوک کامل تصادفی در 2 حالت نوشته ایم که فعلا در جایی گزارش نکرده ام و در کتاب مینی تبم اراده میگردد و در اختیار کاربران کتاب قرار میگیرد). برای ...(بقیه در ادامه مطلب).                                                                    

2- بهترین راه انجام تجزیه علیت یا مسیر یا ضرایب مسیر از طریق نرم افزار ما در مینی تب تحتعنوان MULTPATH (دروبلاگ قرار دارد) است. در ادامه جهت ترسیم نمودار تجزیه علیت یا دیاگرام علیت یا Path diagram به کمک نرم افزار جهانی STAT هست که قیمت آن 860 دلار است (ما این نرم افزار را بصورت فول داریم و عادلانه میفروشیم!) است که مثل آب خوردن صورت میگیرد. دیگر نیازی به ترسیم این نمودار با MS Word نیست. در اینجا نمایی از محیط این برنامه و شکلی که ما با آن ترسیم کرده ایم توجه نمایید. ضمناً نمودار حاصله را بصورت PNG ذخیره کنید.  شکل کارهایتان را به ما بسپارید.


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در پنجشنبه ۷ دی ۱۳۹۱ و ساعت 13:4  
 آذر 91
نزدیک به چاپ شدن کتاب جامع: آمار و طرح آزمایشات در عمل (با تأکید بر کاربرد نرم‌افزار MINITAB).عزیزانی که مایلند این کتاب را داشته باشند می توانند درخواست خودرا به ما ارسال نمایند‌. برای آشنایی با محتوای کتاب به بخشهایی از آن شامل: توزیع لوگ-نرمال و محاسبات ماتریسی با مینی تب توجه نمایید:


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۷ آذر ۱۳۹۱ و ساعت 21:47  
 کارگاه آماری
به اطلاع کاربران عزیز میرسانم که کارگاهی اخیرآ تحت عنوان "تجزیه و تحلیلی آماری" توسط پروفسور محمد مقدم استاد دانشگاه تبریز و همکارشان دکتر مجید نوروزی برگزار گردید که حقیر این کارگاه را بصورت صوتی (با گوشی موبایل!) ذخیره و در اختیار عزیزان قرار میگیرد. در ابتدای این کارگاه دکتر مسعود اصفهانی دبیر کنگره به معرفی آن پرداخته و در لابلای کنگره افرادی مثل دکتر عالمی سعید مدرس دانشگاه رامین به ایراد سوالاتی پرداختند. همچنین این فایل بهمراه فایل متنی آن توسط کنگره 12م زراعت و اصلاح نباتات ایران و جناب آقای دکتر نوروزی همکار خوبمان احتمالاً ارائه میگردد. از آنجایی که حقیر این سخنان و کارگاه را شخصاً ذخیره کرده ام آن را در اینجا در اختیار کاربران وبلاگم قرار میدهم. اطلاعات تکمیلی در صورت لزوم بعدا به اطلاع خواهد رسید.

دانلود فایلها

دانلود متن کارگاه

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در جمعه ۱۷ شهریور ۱۳۹۱ و ساعت 22:34  
 آمار و بیومتری کاربردی در اصلاح نباتات
آمار و بیومتری کاربردی در اصلاح نباتات 

عزیزانی که از جای جای کشور با پیامها و نظرات سازنده و زیباشون به من روحیه دادن و کماکان میدن فقط در جوابشون بگم که: "متشکرم".

1- بحث مهمی که همیشه و معمولا ذهن دانشجویان و محققان بیومتری و اصلاح نبات و دام را بخود مشغول داشته برآورد نرم افزاری ضرایب همبستگی فنوتیپی و ژنوتیپی و نیز انحراف معیار و کواریانس های مربوطه در آزمایشات می باشد. لزوم وجود برنامه ای رایانه ای که به صورت خودکار این پارامترها را برآورد نماید ضروری است. چندی پیش بود که دوستی از بنده خواست برنامه ای رایانه ای را برای این کار بنویسم. بنده خواستم که این کار را انجام دهم. ولی متوجه شدم که استاد ارجمند (James Holland) از آمریکا سه نرم افزار مهم را در SAS ارائه داده که اتفاقا یکی از آنها ضرایب مذکور را برآورد می نماید. دو تای دیگر هم یکی برآورد وراثت پذیری و یا توارث پدیری و دیگری محاسبه ی اپیستازی در نقشه یابی QTL هست. ولی داده هایی که ایشان در سایتشان قرار داده اند ناقص بوده و لذا به ایشان ایمیل زدم که به علت تعطیلی هنوز داده های کامل را برایم نفرستاده اند. ولی عجالتا کد نرم افزاری مذکور را از سایت ایشان دریافت و در نرم افزار SAS به کار ببرید. در ضمن بنده یک نرم افزار SAS 9.1 دارم که نیاز به نصب نداره و با دبل کلیک کردن اجرا میشه و بسیار کم حجمه. لطفا این نرم افزار را از بنده نخواهید چونکه امکان ارسالش با ایمیل نیست.

http://www4.ncsu.edu/~jholland/homepage_files/Software.htm

مقاله اش در این خصوص

--------------------------------------------------------------------------------------

2- (به ادامه مطلب توجه کنید)


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در پنجشنبه ۱۵ دی ۱۳۹۰ و ساعت 19:43  
 کلنی مورچه
کاربرد الگوریتم کلنی مورچه در نقشه یابی QTL های تولید در گندم
این مقاله را (به همراه یک مقاله دیگر) که از رساله دکتری ام می باشد، در کنفرانس ارائه نموده ام. که حاوی مطالب نوینی در خصوص تعیین نقشه لینکاژی نشانگرها یا مارکرهای مولکولی و به دنبال آن نقشه یابی جایگاه های کنترل کننده صفات کی یا کیوتی ال های (QTL) صفات عملکرد و شاخص برداشت در گندم به کمک راهکارهای CIM یا نقشه یابی فاصله ای مرکب و نیز نقشه یابی فاصله ای مرکب مختلط یا MCIM (Mixed composite interval mapping) به کمک نرم افزارهای Windows QTL Cartographer و نیز QTLNetwork برای اولین بار در کشور می باشد. از  اینجا دانلود کنید:

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در شنبه ۱۶ مهر ۱۳۹۰ و ساعت 9:18  
 روش تحقیق، آمار تحلیلی، نگارش آکادمیک، اخلاق پژوهش و انتشار
بنام او

سه مقاله در خصوص مطالب زیر را دانلود کنید. امید که موفق باشید. و در جهت اعتلای ایران اسلامی گام صادقانه بردارید نه مثل برخی از اساتید عزیزی که هدفشان فقط پول است و دیگر هیچ.

مقاله 1

مقاله 2

مقاله 3

البته برای مطالعه یک مقاله فارسی خوب در مورد طرز نگارش مقالات به این آدرس مراجعه کنید:

http://www.tv7.ir/portal/index.php?option=com_content&id=97&showall=1


برخی از عزیزان به بنده مراجعه و از سایتم تعریف و تمجید می کنند. این لطف و موهبت آنها را نشان می دهد. به هر حال هدف بنده خدمت به خلق اله است و بس. یادم نمی آید آخرین بار کی از وبلاگم باز دید کرده ام. زیرا متأسفانه سیستم نظرخواهی آن از کار افتاده و دوستان قادر به ثبت نظرات سازنده شان نیستند. انشاءالله این مشکل حل شود. در ضمن بی توجه به دید و نظر دوستان نیستم. زیرا e-mail را داده ام و مشمول لطف شان هستم.

برخی نیز طرز وبلاگ سازی را خواسته اند. عرض میکنم اکثریت قریب به اتفاق افراد این کار را به صورت تجاری انجام می دهند. ولی ما در حد وسع فی سبیل اله این خدمت را خواهیم داشت. مدتی است که سرم خیلی شلوغ و به زودی طرز وبلاگ سازی را مبسوط اینجا قرار می دهم.

در ضمن  ما در حد توان جهت انجام آنالیزهای آماری، طرح آزمایشی، آنالیزهای مولکولی مثل تشکیل نقشه های لینکاژی و نقشه یابی QTL با برنامه های مختلف در خدمت دوستان هستیم. البته هزینة این کار قبلاً دریافت میگردد!. تماس moula53@hotmail.com

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در جمعه ۱۸ تیر ۱۳۸۹ و ساعت 2:16  
 کتاب جامع  مینی تب (MINITAB) - جلد اول
با سلام به تمام دانش دوستان و دلسوزان دانش در ایران زمین

به اطلاع دوستان خوبم می رسانم که جلد اول کتاب جامع نرم افزار آماری، طرح آزمایشات، ریاضی، کنترل کیفیت مینی تب (MINITAB) که در سه جلد از مبتدی تا پیشرفته تنظیم گردیده است انشاء الله تعالی حداکثر تا اواخر مهر 1391 به زیر چاپ خواهد رفت. برای اخذ این کتاب میتونید آن را پیش خرید کنید. در زیر نمونه هایی از مطالب این کتاب آورده میشه (ادامه مطلب):


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در جمعه ۲۴ اردیبهشت ۱۳۸۹ و ساعت 12:1  
 محاسبات ماتريسي و تجزیه علیت یا تجزیه ضرایب مسیر در ميني تب MINITAB

Matrice Operations in MINITAB software

فايل زير حاوي آنچه لازم است در خصوص عمليات ماتريسي يا محاسبات ماتريسي با نرم افزار ميني تب بدانيد و عمل كنيد. البته لازم به ذکر است که minitab به صورت معمول قادر به محاسبه دترمینان یک ماتریس مربعی نمی باشد ولی به لطف برنامه ای که ما برای مینی تب نوشته ایم این کار به سهولت در این نرم افزار انجام پذیر است

    http://abeyran.googlepages.com/Minitab_Matrice_Operation.doc

----------------------------------------


تجزیه علیت یا تجزیه مسیر با مینی تب

Path Coefficient Analysis via MINITAB

  بحث تجزیه علیت یکی از مهمترین و پراستفاده ترین مسائل علوم مختلف بخصوص کشاورزی و بیولوژی بو انسانی بوده و به کرات استفاده می شود. برای دیدن مقاله های این علم به آدرس www.sid.ir مراجعه شود.  برای انجام تجزیه علیت نرم افزارهای متعددی وجود دارد ولی هیچ کدام به اندازه برنامه ای که در اینجا معرفی می گردد کامل و پرمحتوا نیستند. زیرا برنامه ی ما تجزیه مذکور را به صورت چندمتغیره انجام میدهد.برای اطلاعات بیشتر و دانلود مقاله ی این برنامه به ژورنال: Journal of Crop Improvement, Volume 22, Issue 1 May 2008 , pages 82 - 120، مراجعه کنید. همچنین برای گرفتن کد (اصل) برنامه و ضمیمه ی آن (Chisgof.mac) و دانلود فیلمی که طرز کار با این برنامه را نشان می دهد به اینجا مراجعه فرمائید. توجه: لطفاً بعد از استفاده از این برنامه جهت آشنا شدن محققان کشور با آن در مقاله و تحقیقتان به مقالة مربوطه رفرنس (ارجاع) دهید.  همچنین مشکلات احتمالی را به اینجانب منعکس فرمائید.با تشکر.

اسم مقاله:

MULTPATH: A Comprehensive Minitab Program for Computing Path Coefficients and Multiple Regression for Multivariate Analyses 

--------------------------------------

تجزیه پایداری پارامتری و تجزیه امی (AMMI)

همچنین لازم است به اطلاع برسانم که برنامه ای مبسوط را در نرم افزار مینی تب نوشته ام که بسیار تواناتر از دیگر نرم افزار های رایج در اصلاح نباتات قادر است تجزیه امی (AMMI) یا اثر اصلی جمع پذیر و اثر متقابل ضرب پذیر را که به تجزیه GGEBiplot یا پلات دوگانه GGE برتری دارد، به سرعت و بادقت و جزئیات بالا و گرافیک قوی انجام دهد. فعلاً از ارائه این برنامه در سایت و در اختیار دیگران معذوریم. زیرا 2300 خط برنامه نویسی برده و فقط داده های کاربران را می توانیم بعد از ارسال برایشان آنالیز کنیم. فقط برنامه ای مثل MATMODEL-3 نوشته دوست و همکار عزیزم پروفسور Gauch, H.G. از دانشگاه Cornell آمریکا در برخی جهات می تواند با برنامه مذکور رقابت نماید. به هرحال برای آنالیز داده های تجزیه پایداری تان در کشاورزی مثل تجزیه AMMI و حتی دیگر روش های پایداری پارامتری مثل "ابرهارت و راسل" و "فینلی ویلکینسون" و ... (با برنامه ای دیگر که نوشته ایم) به ما مراجعه کنید.

------------------------------------

نرم افزار آمار چندمتغیره یا Multivariate statistics software NTSYSpc 2.02

نرم افزار  NTSYSpc 2.02 یکی از شناخته شده ترین نرم افزار ها جهت انجام تجزیه چندمتغیره و بخصوص کلاستربندی کدهای ژنتیکی نشانگرهای مولکولی است که به وفور استفاده می شود. با کلیک کردن روی آدرس زیر نرم افزار NTSYSpc 2.02  و راهنمای آن را که ذر داخل پوشه Manuals در قالب Word است را دانلود و با آن کار تجزیه و تحلیل ژنتیکی و ترسیم کلاستر را انجام دهید. در ضمن آخرین نسخة این برنامه 2.2 است.

http://www.speedyshare.com/files/26366368/NTSYSpc-ful.rar

برای منوالهای NTSYSpc

http://www.speedyshare.com/files/26391009/NTSYSpc_2.02_Manuals.rar

-------------------------------------------------------------------------------------------

تجزیه و تحلیل آزمایشات اصلاح نبات آنلاین:
تجزیه میانگین نسل ها و دای آلل ناقص
طرح آگمنت در قالب بلوک های تصادفی
طرح بلوک های تصادفی
تجزیه داده های پیمشایش (مساحی) یا Survey data analysis

در:

http://www.iasri.res.in/analysis/online_analysis.htm

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۱۵ اردیبهشت ۱۳۸۸ و ساعت 11:54  
 ِنرم افزارهاي كاربردي - آماري  

نرم افزارهاي آماري  ، طرح آزمايشي و عمومي

Applicable interactive softwares 

Free Statistics/Genetics softwares:

http://freestatistics.altervista.org/en/stat.php

http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_statistical_packages#Freeware

http://www.math.yorku.ca/SCS/StatResource.html

آدرس سایت خوب زیر در Address Bar اینترنت کپی و Paste شود وگرنه به سایت خارجیی اشتباهی میرود.

binesheamari.blogfa.com

http://forum.vru.ac.ir

Software of Applied Genetics and Plant Breeding

from:

https://plant-breeding.uni-hohenheim.de/software.html

http://lbm.ab.a.u-tokyo.ac.jp/~ukai/front.html

http://www.mybiosoftware.com/population-genetics/5951

SHAPE ver. 3

http://ssc.utexas.edu/software/software-tutorials

http://freedownloadb.com/pdf/design-of-experiments-jmp-software-data-analysis-4364987.html

http://www.jmp.com/software/

......

PBSTAT 1.01 : يك نرم افزار (برنامه) آنلاين براي انجام تجزيه واريانس مركب، برآورد وراثت پذيري عمومي و رگرسيون پايداري بروش فينلي-ويلكينسون Finlay-Wilkinson:

PBSTAT 1.01: A WEB-BASED STATISTICAL ANALYSIS SOFTWARE FOR PARTICIPATORY PLANT BREEDING

مقاله اين برنامه آماري در سايت زير موجود است.

http://willy.situshijau.co.id/downloads/icoms3-pbstat

...... 

دانلود نرم افزار ميني تب MINITAB:

HTTP://WWW.MINITAB.COM    

دانلود ميني تب نسخه 13

Download  MINITAB13 

http://abeyran.googlepages.com/MTB-13-1.rar
http://abeyran.googlepages.com/MTB-13-2.rar

 

دانلود ميني تب نسخه 15

Download  MINITAB15

http://bdfp.persianblog.ir/post/46 

........

دانلود  نرم افزار هاي نقشه يابي ژنتيكي:

:Genetics mapping softwares

http://www.mapmanager.org/qtsoftware.html
http://www.msu.edu/~freed/disks.htm

http://www.sas.com/

http://www.spss.com/

http:/www.spss.com/amos/

http://www.sas.com/technologies/analytics/statistics/stat/index.html/

http://www.ssicentral.com/
http://www.mvsoft.com/

http://lgb.unige.ch/arlequin/

http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin3/

http://lbm.ab.a.u-tokyo.ac.jp/~ukai/front.html
http://www.statsoft.com/

http://statpages.org/javasta2.html

http://journalseek.net/index.htm

http://www.verypdf.com/

http://www.verypdf.com/download/download.htm

 

Folder lock protects your folders:

http://www.newsoftwares.net/folderlock/

Genetics & Breeding related Software:

http://www.plantbreeding.wur.nl/UK/software.html

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در چهارشنبه ۱۱ دی ۱۳۸۷ و ساعت 0:0  
 دانلود بهترين ها

۱- دانلود بهترين ها:

لينكهاي زير احتمالاً بهتريني باشند كه تا بحال در زمينه پيدا كردن نرم افزاري ديده ايد. همه چيز مجاني است. در اين سایتها بهترین نرم افزارهای کامپیوتري، آموزش، زبان ها، صوتی و تصویری، شغلي، ارتباطات، توسعه، آموزشي، بازي و نمايش، گرافيك، سرگرمي، اينترنت و شبكه، امنيت، سرور، سيستمها و ... براحتي قابل دسترسي اند.

http://www.bestfreewaredownload.com/

http://www.fileshome.com/

http://www.4shared.com/

http://www.ineedfile.com

http://www.asandownload.com

http://www.mihandownload.com

http://www.tebyan.com

http://www.filehippo.com

http://www.fileguru.com

http://www.istgah.com/

دانلود کتاب از انجمن بیوانفورماتیک:

http://www.ibp.ir/FreeE-Book.htm 

 http://hbio.ir/ خانه زسیت شناسی

۲- ليست الفبايي نرم‌افزارهاي ژنتيك :    Genetic Analysis Softwares

در سايت زير نرم افزارهاي مختلف آناليز ژنتيك را بيابيد.

http://www.nslij-genetics.org/soft/

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در جمعه ۱۴ دی ۱۳۸۶ و ساعت 10:40  
 آمار و طرح آزمايشات

 آمار و طرح آزمايشات 

برای گرفتن کتابها و مطالب آمار ساده، چند متغیره و طرح آزمایشات به سایتهای زیر بروید:

http://psych.colorado.edu/~carey/Courses/PSYC7291/ClassHandouts.htm

http://www2.chass.ncsu.edu/garson/pa765/links.htm

 

دستور کار نرم افزار آماری      SAS user`s Guide

به اطلاع عزيزاني كه دستي در آمار و طرح آزمايشات دارند مي رسانيم، كتاب ارزشمند فوق را مي توانيد (در ۷۲ فصل و در حدود ۴۰۰۰صفحه pdf) در سايت هاي زير بيابيد و پرينت بگيريد. موفق باشيد.

http://abeyran.googlepages.com/Chps-1-20.zip 

http://abeyran.googlepages.com/Chps-21-25.zip

http://abeyran.googlepages.com/Chps-26-30.zip

http://abeyran.googlepages.com/Chps-31-40.zip

http://abeyran.googlepages.com/Chps-41-60.zip

http://abeyran.googlepages.com/Chps-61-70.zip

           و يا از طريق:

http://www2.stat.unibo.it/ManualiSas

------------------------------------------------------------------

نرمال کردن (نرمال سازی، نرمال نمودن) داده های آماری با نرم افزار مینی تب Data Normalization:

برای نرمال کردن داده های غیرنرمال و تجزیه و تحلیل آنها چندین روش وجود دارد که تبدیل داده ها یا Data transformation یکی از بهترین راهکارهاست. برای این کار نرم افزار مینی تب بهترین است. اگر باور ندارید امتحان کنید. فایل زیر را دانلود و فقط بصورت شخصی استفاده کنید که بخشی از کتاب مینی تبمه که در آبنده انشالا چاپ میشه. میتونید اونو پیش خرید کنید. دانلود فایل

---------------------------------------------------------------------------------

همچنين براي استفاده از جداول توزيعهاي آماري (Z, t, Binomial etc) به اينجا مراجعه كنيد:

http://www.statsoft.com/textbook/sttable.html

http://fsweb.berry.edu/academic/education/vbissonnette/tables/tables.html

 

يافتن ريشه معادلات خطي تا درجه ۴ بصورت آنلاين:

Root-finding Routines

http://www.akiti.ca/Mathfxns.html

 

 

|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در سه شنبه ۲۴ مهر ۱۳۸۶ و ساعت 15:17  
 QTL
جايگاه های ژنی صفات کمی -  (Quantitative Trait Loci (QTL

بروز شده در ۸/۱۱/۸۶

لطفاً روی سايتهاي زير کليک کنيد:

توابع نقشه يابي (هالدين و كوزامبي):

http://www.ndsu.edu/ndsu/abergstr/webcourses/genetics/mf/mf02.htm

http://www.stat.wisc.edu/~yandell/statgen/reference/qtl.html

 

براي گرفتن نرم افزار هاي مربوطه به سايتهاي زير برويد:

ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software

http://www.broad.mit.edu/ftp/distribution/software

:Softwares for Molecular Markers & QTL Analyses

http://www.eadgene.info/ToolsResources/RepositoryofAnalyticalTools/SoftwareforMolecularMarkersQTLAnalyses/tabid/333/Default.aspx

 

http://www.stat.wisc.edu/~yandell/statgen/software/biosci/linkage.html#linkage  

  Statistical Genetics: Gene Mapping Through Linkage and Association  

*************************** 

چند مقاله فارسي در زمينه نقشه يابي QTL :

لازم به ذكر است كه اين مقاله ها در مجله علوم كشاورزي ايران-كرج چاپ شده و بصورت آنلاين و مجاني قابل دسترسي اند.

۱- نقشه يابي QTL ها در گندم            QTL mapping of wheat (Triticum aestivum 

     http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi1.zip

۲ - نقشه يابي QTL ها در گندم           QTL mapping of wheat (Triticum aestivum


http://abeyran.googlepages.com/QTlwheat-farsi2.zip

۳- ترسيم نقشه ژنتيكي جو با AFLP mapping of Barley using AFLP (Hordeum vulgare     AFLP


http://abeyran.googlepages.com/BarleymappingviaAFLP-farsi.zip

4- نقشه يابي QTL هاي روغن در كلزا    QTL mapping of Canola oil (Brassica napus

http://abeyran.googlepages.com/QTLcanola-farsi.zip

 

۵- آناليز ژنتيکي و تعيين نقشه مولکولي QTL هاي مرتبط با مقاومت به خشکي در ذرت

انستيتو تحقيقات کشاورزي هند (پوسا) ـ دهلي

هدف از مطالعه فوق را مي توان در سه بخش خلاصه كرد:

الف) آناليز تنوع ژنتيکي در ژرم پلاسم ذرت براي مقاومت به خشکي و تشخيص لاين ها و هيبريد هاي مقاوم به خشکي.

ب) مطالعه پلي مورفيسم در لاين هاي مقاوم و حساس انتخابي.

ج) تعيين نقشه QTL هاي صفات مختلف مرتبط با خشکي.

آزمايش با استفاده از 76 اينبرد لاين مختلف در دو آزمايش جداگانه در سالهاي زراعي 2002-2001 و 2004-2003 در شهر حيدرآباد انجام گرفت و 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي در شرايط استرس خشکي و نرمال اندازه گيري گرديد. مطالعه فوق نشان داد که بسياري از لاين هاي مکزيکي و هندي در زمان گلدهي شديدا تحت تاثير خشکي واقع مي شوند. در مجموع 3 لاين از کشور هند IPA29B، FSA17 و CM140 و 10 لاين از سيميت به شرايط خشکي در زمان گلدهي مقاومت بسيار بالايي را نشان دادند. مطالعه پلي مورفيسم با استفاده از 12 لاين مختلف با واکنشهاي متفاوت به خشکي انجام گرفت. از مجموع 110 مارکر SSR، 71 مارکر  پلي مورفيسم نشان دادند. در تحقيق فوق مجموعا 331 الل SSR و به طور متوسط 69/4 الل در هر لوکوس مشخص گرديد. در آناليزهاي Clustering،Bootstrap و Principal component، تعداد 4 کلاستر عمده تشخيص داده شد که به طور وضوح لاينهاي مقاوم به خشکي تامين شده توسط سيميت از بقيه لاين ها متمايز بودند.

براي تعيين نقشه QTL هاي مرتبط با صفات متاثر از خشکي در ذرت از لاين هاي نوترکيب Recombinant Inbred Line (RIL) استفاده شد. جمعيت فوق شامل 210 RIL Families  است که از تلاقي دو لاين مقاوم (Ac7643) و حساس (Ac7729) به خشکي توليد شده اند. 210 لاين نو ترکيب فوق در قالب طرح آلفا لاتيس و در دو شهر کريم نگر(2003-2002) و حيدرآباد(2004-2003) و در فصل زمستان (فصل خشک) کشت و بعد از استرس خشکي، 15 صفت مختلف مرتبط با خشکي يادداشت برداري شد. آناليز داده هاي فوق با استفاده از مدل Composite Interval Mapping  منجر به تعيين 52QTL براي صفات مختلف در آزمايش کريم نگر (شامل 22 QTL  در شرايط نرمال و 30 QTL در   شرايط خشکي) و 14QTL  در شرايط استرس خشکي در آزمايش   حيدرآباد گرديد.

مقايسه نتايج حاصل از داده هاي حيدرآباد و کريم نگر وجود QTL هايي روي کروموزومهاي شماره 1، 2، 8 و 10 را مشخص نمود، که در شرايط استرس خشکي در هر دو ناحيه حيدرآباد و کريم نگر صفات بخصوصي را تحت تاثير قرار مي دهند. نتايج مشابه حاصل از مطالعه فوق با نتايج حاصل از مطالعات سيميت در مکزيک و کنيا روي لاين هاي نوترکيب يکسان QTL هاي عمومي را مکشوف مي سازد که ارزش بسيار بالايي در اصلاح ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي دارند. مطالعه فوق براي اولين بار در هند انجام مي گيرد و مي تواند نقش بسزايي در انتخاب، اصلاح و بهبود ذرت براي مقاومت به خشکي توسط مارکرهاي مولکولي و روش  Marker Assisted Breeding  به ارمغان آورد.

به نقل از http://sinaps-s.blogfa.com/86034.aspx

------------------------------------------------------------------

نرم افزارهای مورد استفاده در تهیه نقشه های ژنتیکی

نرم افزارهای مورد استفاده در تهیه نقشه های ژنتیکی

نرم افزارهای مختلفی برای ترسیم نقشه های ژنی وجود دارد. اما تفاوت اساسی آنها در الگوریتم های به کار رفته برای مرتب کردن نشانگرها و نوع جمعیتی که استفاده شده است؛ می باشد. در ترسیم نقشه جمعیت های کوچک و فامیل های نسبتاً دور (مانند انسان و اصلاح دام) اطلاعات مربوط به 2 یا 3 نسل متوالی مورد استفاده قرار می گیرد و از نرم افزارهای لینکاژ (Linkage) یا کری مپ (Crimap) استفاده می شود. نرم افزار مپ میکر (Mapmaker) غالباً در جمعیت های .... (به ادامه مطلب بروید):

به نقل از علیرضا سیدمحمدی و تشکر از ایشان در سایت: http://alireza1979.blogfa.com/post-25.aspx

 


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 14:0  
 بیوانفورماتیک
بیوانفورماتیک 

 Bioinformatics‌‌‌

انجمن بیوانفورماتیک ایران

 به نقل از سایت:

http://fa.wikipedia.org/wiki/%D8%A8%DB%8C%D9%88%D8%A7%D9%86%D9%81%D9%88%D8%B1%D9%85%D8%A7%D8%AA%DB%8C%DA%A9

بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از کامپیوتر، نرم‌افزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی می‌گردد تا به مسائل بیولوژیکی بخصوص در زمینه‌های سلولی و ملکولی پاسخ داده شود. در این علم با بکارگیری کامپیوتر سعی می‌گردد تا تحقیقات وسیعتری در خصوص پروتئین‌ها و ژنها بعمل آید.

دو فعالیت برجسته‌ای که بیوانفورماتیک دانان به آن مشغول هستند پروتئومیک و ژنومیک می‌باشد.

ژنومیک شامل ...


ادامه مطلب
|+| نوشته شده توسط ع. آرمينيان (Ph.D) در یکشنبه ۲۰ اسفند ۱۳۸۵ و ساعت 13:28